RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619517.4

PDZRN3-AS1-204, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 613 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
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PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.04■□□□□ -0
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PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 CAPN15O75808 1086 aa14.15□□□□□ -0.14
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 DSG3P32926 999 aa14.11□□□□□ -0.15
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
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PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 POLA2Q14181 598 aa13.62□□□□□ -0.23
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PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 SPDYE2Q495Y8 402 aa12.97□□□□□ -0.33
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.9□□□□□ -0.34
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 PITPNM1O00562 1244 aa12.88□□□□□ -0.35
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.82□□□□□ -0.36
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 SSUH2Q9Y2M2 353 aa12.82□□□□□ -0.36
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
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PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 CLEC11AQ9Y240 323 aa12.63□□□□□ -0.39
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP12.61□□□□□ -0.39
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PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 PRR29P0C7W0 189 aa12.47□□□□□ -0.41
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 EVX2Q03828 476 aa12.42□□□□□ -0.42
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.4□□□□□ -0.42
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 CHADLQ6NUI6 762 aa12.39□□□□□ -0.43
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 C19orf67A6NJJ6 358 aa12.37□□□□□ -0.43
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.31□□□□□ -0.44
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 CREBZFQ9NS37 354 aa12.21□□□□□ -0.45
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 PROM2Q8N271 834 aa12.18□□□□□ -0.46
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 GABBR2O75899 941 aa12.15□□□□□ -0.46
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 CD44P16070 742 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa12.12□□□□□ -0.47
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 CLCN6P51797 869 aa12.04□□□□□ -0.48
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 ZRANB1Q9UGI0 708 aa11.98□□□□□ -0.49
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 POTEIP0CG38 1075 aa11.9□□□□□ -0.5
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 FKBP8Q14318 412 aa11.84□□□□□ -0.51
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.82□□□□□ -0.52
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.81□□□□□ -0.52
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 PHF12Q96QT6 1004 aa11.81□□□□□ -0.52
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 MIER1Q8N108 512 aa11.8□□□□□ -0.52
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 PLEKHG5O94827 1062 aa11.79□□□□□ -0.52
PDZRN3-AS1-204ENST00000619517 LHX8Q68G74 356 aa11.79□□□□□ -0.52
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