RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000181114.5

1700028E10Rik-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene 1700028E10Rik, Length 2,034 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 NischQ80TM9 1593 aa38.9■■■■□ 3.82
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa38.78■■■■□ 3.8
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Abcc9P70170 1546 aa37.8■■■■□ 3.64
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Abcc8B2RUS7 1588 aa37.2■■■■□ 3.55
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 ScribQ80U72 1612 aa35.07■■■■□ 3.2
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Rhox8Q6VSS7 320 aa34.98■■■■□ 3.19
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Dcaf1Q80TR8 1506 aa34.65■■■■□ 3.14
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Kdm5dQ62240 1548 aa34.22■■■■□ 3.07
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Rtl1Q7M732 1744 aa34.11■■■■□ 3.05
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 NacadQ5SWP3 1504 aa34.07■■■■□ 3.04
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa34.02■■■■□ 3.04
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Ccdc180J3QNE4 1664 aa33.79■■■■□ 3
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Baz1aO88379 1555 aa33.64■■■□□ 2.97
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Sycp2Q9CUU3 1500 aa33.36■■■□□ 2.93
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Crybg2B7ZCC2 1516 aa33.26■■■□□ 2.92
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Smarca2Q6DIC0 1577 aa32.83■■■□□ 2.85
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 BicraF8VPZ9 1578 aa32.71■■■□□ 2.83
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa32.55■■■□□ 2.8
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa32.17■■■□□ 2.74
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Trim41Q5NCC3 630 aa32.05■■■□□ 2.72
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 HrcG5E8J6 738 aa31.78■■■□□ 2.68
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Synj1Q8CHC4 1574 aa31.76■■■□□ 2.67
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 CftrP26361 1476 aa31.66■■■□□ 2.66
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa31.56■■■□□ 2.64
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa31.38■■■□□ 2.61
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Golga3P55937 1487 aa31.36■■■□□ 2.61
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Cngb1E1AZ71 1325 aa31.2■■■□□ 2.58
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Top2bQ64511 1612 aa31.18■■■□□ 2.58
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.57
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Cep164Q5DU05 1446 aa31.13■■■□□ 2.57
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa30.95■■■□□ 2.55
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Chic1Q8CBW7 227 aa30.91■■■□□ 2.54
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Wdr62Q3U3T8 1523 aa30.88■■■□□ 2.53
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Frmpd1A2AKB4 1549 aa30.86■■■□□ 2.53
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa30.82■■■□□ 2.52
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Ercc6F8VPZ5 1481 aa30.76■■■□□ 2.51
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Fmn1Q05860 1466 aa30.7■■■□□ 2.5
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Unc13aQ4KUS2 1712 aa30.55■■■□□ 2.48
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 TnnQ80Z71 1560 aa30.5■■■□□ 2.47
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Lamc3Q9R0B6 1581 aa30.39■■■□□ 2.46
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Gab3Q8BSM5 595 aa30.37■■■□□ 2.45
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Fam135aQ6NS59 1506 aa30.22■■■□□ 2.43
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Kif15Q6P9L6 1387 aa30.2■■■□□ 2.43
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa30.14■■■□□ 2.41
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Camsap1A2AHC3 1581 aa30.02■■■□□ 2.4
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Ubl4bQ9CQ84 188 aa29.96■■■□□ 2.39
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Ccdc18Q640L5 1455 aa29.88■■■□□ 2.37
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Cux2P70298 1426 aa29.86■■■□□ 2.37
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Cep162Q6ZQ06 1403 aa29.86■■■□□ 2.37
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Il27Q8K3I6 234 aa29.79■■■□□ 2.36
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Baz1bQ9Z277 1479 aa29.78■■■□□ 2.36
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 NrkQ9R0G8 1455 aa29.78■■■□□ 2.36
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 PtprkP35822 1457 aa29.76■■■□□ 2.35
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Grin2bQ01097 1482 aa29.74■■■□□ 2.35
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa29.73■■■□□ 2.35
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Shroom4Q1W617 1475 aa29.71■■■□□ 2.35
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Npm2Q80W85 207 aa29.69■■■□□ 2.34
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa29.61■■■□□ 2.33
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Arhgap35Q91YM2 1499 aa29.6■■■□□ 2.33
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Mrc2Q64449 1479 aa29.52■■■□□ 2.32
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Myt1lP97500 1187 aa29.49■■■□□ 2.31
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Map3k1P53349 1493 aa29.47■■■□□ 2.31
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Efcab5A0JP43 1406 aa29.45■■■□□ 2.31
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Duox2A2AQ99 1517 aa29.41■■■□□ 2.3
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa29.39■■■□□ 2.3
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Kif21aQ9QXL2 1672 aa29.35■■■□□ 2.29
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Clip1Q922J3 1391 aa29.24■■■□□ 2.27
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Crocc2F6XLV1 1638 aa29.22■■■□□ 2.27
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Samd9lQ69Z37 1561 aa29.22■■■□□ 2.27
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Zeb1Q64318 1117 aa29.18■■■□□ 2.26
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Eea1Q8BL66 1411 aa29.13■■■□□ 2.25
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 SynmQ70IV5 1561 aa29.11■■■□□ 2.25
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Carmil1Q6EDY6 1374 aa29.08■■■□□ 2.25
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Arap1Q4LDD4 1452 aa29.06■■■□□ 2.24
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Ankrd26Q811D2 1581 aa29.03■■■□□ 2.24
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Setd5Q5XJV7 1441 aa29.02■■■□□ 2.24
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Erich3F6QRE9 1637 aa29.02■■■□□ 2.24
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Rad54l2Q99NG0 1466 aa28.99■■■□□ 2.23
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Plb1Q3TTY0 1478 aa28.98■■■□□ 2.23
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa28.97■■■□□ 2.23
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Cux1P53564 1515 aa28.93■■■□□ 2.22
1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 Magi3Q9EQJ9 1476 aa28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 286 ms