RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000164147.7

Rbms1-209, Transcript of RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rbms1, Length 2,543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbms1-209ENSMUST00000164147 NischQ80TM9 1593 aa36.1■■■■□ 3.37
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Abcc9P70170 1546 aa34.99■■■■□ 3.19
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Abcc8B2RUS7 1588 aa34.44■■■■□ 3.1
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Rhox8Q6VSS7 320 aa33.01■■■□□ 2.88
Rbms1-209ENSMUST00000164147 ScribQ80U72 1612 aa32.43■■■□□ 2.78
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Dcaf1Q80TR8 1506 aa31.87■■■□□ 2.69
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Kdm5dQ62240 1548 aa31.7■■■□□ 2.67
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Rtl1Q7M732 1744 aa31.6■■■□□ 2.65
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa31.58■■■□□ 2.65
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Baz1aO88379 1555 aa31.16■■■□□ 2.58
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ccdc180J3QNE4 1664 aa31■■■□□ 2.55
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Sycp2Q9CUU3 1500 aa30.81■■■□□ 2.52
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa30.76■■■□□ 2.51
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Crybg2B7ZCC2 1516 aa30.6■■■□□ 2.49
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 BicraF8VPZ9 1578 aa30.26■■■□□ 2.43
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa29.99■■■□□ 2.39
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Synj1Q8CHC4 1574 aa29.55■■■□□ 2.32
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa29.54■■■□□ 2.32
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Cngb1E1AZ71 1325 aa29.41■■■□□ 2.3
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa29.18■■■□□ 2.26
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Chic1Q8CBW7 227 aa29.15■■■□□ 2.26
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Cep164Q5DU05 1446 aa29.09■■■□□ 2.25
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa29.03■■■□□ 2.24
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Top2bQ64511 1612 aa28.89■■■□□ 2.22
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Gab3Q8BSM5 595 aa28.81■■■□□ 2.2
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa28.71■■■□□ 2.19
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Frmpd1A2AKB4 1549 aa28.59■■■□□ 2.17
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Wdr62Q3U3T8 1523 aa28.53■■■□□ 2.16
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Fmn1Q05860 1466 aa28.49■■■□□ 2.15
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ercc6F8VPZ5 1481 aa28.41■■■□□ 2.14
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Unc13aQ4KUS2 1712 aa28.19■■■□□ 2.1
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa28.09■■■□□ 2.09
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Lamc3Q9R0B6 1581 aa28.09■■■□□ 2.09
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ubl4bQ9CQ84 188 aa27.91■■■□□ 2.06
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Myt1lP97500 1187 aa27.9■■■□□ 2.06
Rbms1-209ENSMUST00000164147 PtprkP35822 1457 aa27.83■■■□□ 2.05
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Camsap1A2AHC3 1581 aa27.83■■■□□ 2.05
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Fam135aQ6NS59 1506 aa27.78■■■□□ 2.04
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Cux2P70298 1426 aa27.77■■■□□ 2.04
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa27.74■■■□□ 2.03
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ccdc18Q640L5 1455 aa27.72■■■□□ 2.03
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Grin2bQ01097 1482 aa27.62■■■□□ 2.01
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Arhgap35Q91YM2 1499 aa27.61■■■□□ 2.01
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Clip1Q922J3 1391 aa27.41■■□□□ 1.98
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa27.33■■□□□ 1.97
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa27.3■■□□□ 1.96
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Setd5Q5XJV7 1441 aa27.18■■□□□ 1.94
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Kif21aQ9QXL2 1672 aa27.16■■□□□ 1.94
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Samd9lQ69Z37 1561 aa27.15■■□□□ 1.94
Rbms1-209ENSMUST00000164147 NefmP08553 848 aa27.13■■□□□ 1.93
Rbms1-209ENSMUST00000164147 Rad54l2Q99NG0 1466 aa27.08■■□□□ 1.92
Rbms1-209ENSMUST00000164147 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
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Rbms1-209ENSMUST00000164147 Ankrd26Q811D2 1581 aa27.03■■□□□ 1.92
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