RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000118023.1

Cct3-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Cct3-ps1, Length 1,647 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa28.08■■■□□ 2.09
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 NischQ80TM9 1593 aa28.06■■■□□ 2.08
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Abcc9P70170 1546 aa27.29■■□□□ 1.96
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Abcc8B2RUS7 1588 aa26.86■■□□□ 1.89
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 ScribQ80U72 1612 aa25.28■■□□□ 1.64
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Dcaf1Q80TR8 1506 aa25.14■■□□□ 1.62
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Rhox8Q6VSS7 320 aa25.08■■□□□ 1.6
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Kdm5dQ62240 1548 aa24.68■■□□□ 1.54
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Rtl1Q7M732 1744 aa24.66■■□□□ 1.54
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 NacadQ5SWP3 1504 aa24.66■■□□□ 1.54
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.55■■□□□ 1.52
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa24.52■■□□□ 1.52
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Baz1aO88379 1555 aa24.3■■□□□ 1.48
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Crybg2B7ZCC2 1516 aa24.15■■□□□ 1.46
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Sycp2Q9CUU3 1500 aa24.12■■□□□ 1.45
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Smarca2Q6DIC0 1577 aa23.7■■□□□ 1.38
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 BicraF8VPZ9 1578 aa23.6■■□□□ 1.37
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa23.29■■□□□ 1.32
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Trim41Q5NCC3 630 aa23.13■■□□□ 1.29
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa23.12■■□□□ 1.29
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 HrcG5E8J6 738 aa22.93■■□□□ 1.26
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa22.86■■□□□ 1.25
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Synj1Q8CHC4 1574 aa22.86■■□□□ 1.25
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 CftrP26361 1476 aa22.84■■□□□ 1.25
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa22.81■■□□□ 1.24
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa22.66■■□□□ 1.22
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Golga3P55937 1487 aa22.61■■□□□ 1.21
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Top2bQ64511 1612 aa22.49■■□□□ 1.19
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Cep164Q5DU05 1446 aa22.42■■□□□ 1.18
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Cngb1E1AZ71 1325 aa22.36■■□□□ 1.17
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Wdr62Q3U3T8 1523 aa22.32■■□□□ 1.16
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Frmpd1A2AKB4 1549 aa22.28■■□□□ 1.16
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Ercc6F8VPZ5 1481 aa22.27■■□□□ 1.16
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa22.21■■□□□ 1.15
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa22.18■■□□□ 1.14
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Fmn1Q05860 1466 aa22.17■■□□□ 1.14
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Chic1Q8CBW7 227 aa22.13■■□□□ 1.13
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 TnnQ80Z71 1560 aa22.03■■□□□ 1.12
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Unc13aQ4KUS2 1712 aa22.01■■□□□ 1.11
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Lamc3Q9R0B6 1581 aa21.97■■□□□ 1.11
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Fam135aQ6NS59 1506 aa21.97■■□□□ 1.11
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Baz1bQ9Z277 1479 aa21.79■■□□□ 1.08
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Kif15Q6P9L6 1387 aa21.77■■□□□ 1.08
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa21.71■■□□□ 1.07
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa21.71■■□□□ 1.07
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Gab3Q8BSM5 595 aa21.69■■□□□ 1.06
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.68■■□□□ 1.06
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Camsap1A2AHC3 1581 aa21.66■■□□□ 1.06
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Ccdc18Q640L5 1455 aa21.61■■□□□ 1.05
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Cux2P70298 1426 aa21.55■■□□□ 1.04
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 NrkQ9R0G8 1455 aa21.53■■□□□ 1.04
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Cep162Q6ZQ06 1403 aa21.5■■□□□ 1.03
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Mrc2Q64449 1479 aa21.47■■□□□ 1.03
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Grin2bQ01097 1482 aa21.46■■□□□ 1.03
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Shroom4Q1W617 1475 aa21.44■■□□□ 1.02
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 PtprkP35822 1457 aa21.37■■□□□ 1.01
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Il27Q8K3I6 234 aa21.35■■□□□ 1.01
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa21.32■■□□□ 1
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Npm2Q80W85 207 aa21.32■■□□□ 1
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Efcab5A0JP43 1406 aa21.31■■□□□ 1
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Map3k1P53349 1493 aa21.31■■□□□ 1
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Arhgap35Q91YM2 1499 aa21.3■■□□□ 1
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Duox2A2AQ99 1517 aa21.21■□□□□ 0.99
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa21.2■□□□□ 0.98
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Kif21aQ9QXL2 1672 aa21.15■□□□□ 0.98
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Myt1lP97500 1187 aa21.1■□□□□ 0.97
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Crocc2F6XLV1 1638 aa21.1■□□□□ 0.97
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Clip1Q922J3 1391 aa21.08■□□□□ 0.96
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Samd9lQ69Z37 1561 aa21.04■□□□□ 0.96
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa21.04■□□□□ 0.96
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 SynmQ70IV5 1561 aa21.02■□□□□ 0.96
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Carmil1Q6EDY6 1374 aa21.01■□□□□ 0.95
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Eea1Q8BL66 1411 aa21■□□□□ 0.95
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Zeb1Q64318 1117 aa20.95■□□□□ 0.94
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Erich3F6QRE9 1637 aa20.94■□□□□ 0.94
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Ankrd26Q811D2 1581 aa20.89■□□□□ 0.93
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Plb1Q3TTY0 1478 aa20.89■□□□□ 0.93
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Setd5Q5XJV7 1441 aa20.88■□□□□ 0.93
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Arap1Q4LDD4 1452 aa20.88■□□□□ 0.93
Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 Rpap1Q80TE0 1409 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 75.3 ms