RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000071667.8

Siah1b-202, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Siah1b, Length 1,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1b-202ENSMUST00000071667 NischQ80TM9 1593 aa45,49■■■■■ 4,87
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa45,39■■■■■ 4,86
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Abcc9P70170 1546 aa44,2■■■■■ 4,67
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Abcc8B2RUS7 1588 aa43,55■■■■■ 4,56
Siah1b-202ENSMUST00000071667 ScribQ80U72 1612 aa41,04■■■■■ 4,16
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Rhox8Q6VSS7 320 aa40,82■■■■■ 4,13
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Dcaf1Q80TR8 1506 aa40,61■■■■■ 4,09
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Kdm5dQ62240 1548 aa40,07■■■■■ 4,01
Siah1b-202ENSMUST00000071667 NacadQ5SWP3 1504 aa39,99■■■■□ 3,99
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa39,76■■■■□ 3,96
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Rtl1Q7M732 1744 aa39,64■■■■□ 3,94
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Ccdc180J3QNE4 1664 aa39,52■■■■□ 3,92
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Baz1aO88379 1555 aa39,34■■■■□ 3,89
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Sycp2Q9CUU3 1500 aa39,14■■■■□ 3,86
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Crybg2B7ZCC2 1516 aa39,01■■■■□ 3,83
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP38,48■■■■□ 3,75
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Smarca2Q6DIC0 1577 aa38,36■■■■□ 3,73
Siah1b-202ENSMUST00000071667 BicraF8VPZ9 1578 aa38,31■■■■□ 3,72
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa37,95■■■■□ 3,67
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa37,59■■■■□ 3,61
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Trim41Q5NCC3 630 aa37,5■■■■□ 3,59
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP37,4■■■■□ 3,58
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP37,2■■■■□ 3,55
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Synj1Q8CHC4 1574 aa37,09■■■■□ 3,53
Siah1b-202ENSMUST00000071667 CftrP26361 1476 aa37,04■■■■□ 3,52
Siah1b-202ENSMUST00000071667 HrcG5E8J6 738 aa37,01■■■■□ 3,51
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP36,96■■■■□ 3,51
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP36,92■■■■□ 3,5
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa36,92■■■■□ 3,5
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa36,78■■■■□ 3,48
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Golga3P55937 1487 aa36,64■■■■□ 3,46
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP36,47■■■■□ 3,43
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Cngb1E1AZ71 1325 aa36,42■■■■□ 3,42
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Top2bQ64511 1612 aa36,36■■■■□ 3,41
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Cep164Q5DU05 1446 aa36,23■■■■□ 3,39
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Wdr62Q3U3T8 1523 aa36,23■■■■□ 3,39
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Ercc6F8VPZ5 1481 aa36,19■■■■□ 3,38
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Frmpd1A2AKB4 1549 aa36,19■■■■□ 3,38
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP36,12■■■■□ 3,37
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa36,03■■■■□ 3,36
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP36,01■■■■□ 3,36
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Chic1Q8CBW7 227 aa35,97■■■■□ 3,35
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Fmn1Q05860 1466 aa35,9■■■■□ 3,34
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa35,89■■■■□ 3,34
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Unc13aQ4KUS2 1712 aa35,67■■■■□ 3,3
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP35,65■■■■□ 3,3
Siah1b-202ENSMUST00000071667 TnnQ80Z71 1560 aa35,65■■■■□ 3,3
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Lamc3Q9R0B6 1581 aa35,59■■■■□ 3,29
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Fam135aQ6NS59 1506 aa35,54■■■■□ 3,28
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP35,53■■■■□ 3,28
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Kif15Q6P9L6 1387 aa35,42■■■■□ 3,26
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Gab3Q8BSM5 595 aa35,34■■■■□ 3,25
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Ubl4bQ9CQ84 188 aa35,23■■■■□ 3,23
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Baz1bQ9Z277 1479 aa35,19■■■■□ 3,22
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa35,13■■■■□ 3,21
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Camsap1A2AHC3 1581 aa35,12■■■■□ 3,21
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Ccdc18Q640L5 1455 aa35,06■■■■□ 3,2
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Cux2P70298 1426 aa35,04■■■■□ 3,2
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa34,97■■■■□ 3,19
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Il27Q8K3I6 234 aa34,87■■■■□ 3,17
Siah1b-202ENSMUST00000071667 NrkQ9R0G8 1455 aa34,85■■■■□ 3,17
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Cep162Q6ZQ06 1403 aa34,83■■■■□ 3,17
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Grin2bQ01097 1482 aa34,81■■■■□ 3,16
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP34,79■■■■□ 3,16
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Shroom4Q1W617 1475 aa34,74■■■■□ 3,15
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Mrc2Q64449 1479 aa34,72■■■■□ 3,15
Siah1b-202ENSMUST00000071667 PtprkP35822 1457 aa34,71■■■■□ 3,15
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Npm2Q80W85 207 aa34,71■■■■□ 3,15
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP34,71■■■■□ 3,15
Siah1b-202ENSMUST00000071667 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP34,66■■■■□ 3,14
Siah1b-202ENSMUST00000071667 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP34,57■■■■□ 3,13
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP34,57■■■■□ 3,12
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Efcab5A0JP43 1406 aa34,53■■■■□ 3,12
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Arhgap35Q91YM2 1499 aa34,53■■■■□ 3,12
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Map3k1P53349 1493 aa34,45■■■■□ 3,11
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Duox2A2AQ99 1517 aa34,44■■■■□ 3,1
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP34,43■■■■□ 3,1
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Myt1lP97500 1187 aa34,38■■■■□ 3,09
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Kif21aQ9QXL2 1672 aa34,36■■■■□ 3,09
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa34,35■■■■□ 3,09
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Crocc2F6XLV1 1638 aa34,25■■■■□ 3,07
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP34,23■■■■□ 3,07
Siah1b-202ENSMUST00000071667 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP34,21■■■■□ 3,07
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa34,2■■■■□ 3,07
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Clip1Q922J3 1391 aa34,18■■■■□ 3,06
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Zeb1Q64318 1117 aa34,17■■■■□ 3,06
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Samd9lQ69Z37 1561 aa34,16■■■■□ 3,06
Siah1b-202ENSMUST00000071667 SynmQ70IV5 1561 aa34,06■■■■□ 3,04
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Carmil1Q6EDY6 1374 aa34,05■■■■□ 3,04
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Eea1Q8BL66 1411 aa34,01■■■■□ 3,03
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Plb1Q3TTY0 1478 aa34■■■■□ 3,03
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP33,95■■■■□ 3,03
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Rad54l2Q99NG0 1466 aa33,92■■■■□ 3,02
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Setd5Q5XJV7 1441 aa33,88■■■■□ 3,01
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Ankrd26Q811D2 1581 aa33,84■■■■□ 3,01
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Arap1Q4LDD4 1452 aa33,83■■■■□ 3,01
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Erich3F6QRE9 1637 aa33,82■■■■□ 3
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Disp1Q3TDN0 1521 aa33,81■■■■□ 3
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Ift140E9PY46 1464 aa33,8■■■■□ 3
Siah1b-202ENSMUST00000071667 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa33,8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 64 ms