RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000052798.13

Ptges3-201, Transcript of Prostaglandin E synthase 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptges3, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptges3-201ENSMUST00000052798 NischQ80TM9 1593 aa37.28■■■■□ 3.56
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Ptges3-201ENSMUST00000052798 Abcc8B2RUS7 1588 aa35.56■■■■□ 3.28
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Ptges3-201ENSMUST00000052798 ScribQ80U72 1612 aa33.37■■■□□ 2.93
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Rtl1Q7M732 1744 aa33.27■■■□□ 2.92
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Ptges3-201ENSMUST00000052798 Kdm5dQ62240 1548 aa32.62■■■□□ 2.81
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Ptges3-201ENSMUST00000052798 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa29.67■■■□□ 2.34
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Ptges3-201ENSMUST00000052798 Wdr62Q3U3T8 1523 aa29.38■■■□□ 2.29
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Ptges3-201ENSMUST00000052798 Ercc6F8VPZ5 1481 aa29.21■■■□□ 2.27
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Ptges3-201ENSMUST00000052798 Unc13aQ4KUS2 1712 aa29.12■■■□□ 2.25
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Ptges3-201ENSMUST00000052798 Fam135aQ6NS59 1506 aa28.62■■■□□ 2.17
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Myt1lP97500 1187 aa28.59■■■□□ 2.17
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Il27Q8K3I6 234 aa28.59■■■□□ 2.17
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Ccdc18Q640L5 1455 aa28.58■■■□□ 2.17
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Shroom4Q1W617 1475 aa28.55■■■□□ 2.16
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Arhgap35Q91YM2 1499 aa28.55■■■□□ 2.16
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Ubl4bQ9CQ84 188 aa28.52■■■□□ 2.16
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Grin2bQ01097 1482 aa28.5■■■□□ 2.15
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Cux2P70298 1426 aa28.48■■■□□ 2.15
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Mier1Q5UAK0 511 aa28.37■■■□□ 2.13
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Map3k1P53349 1493 aa28.36■■■□□ 2.13
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Clip1Q922J3 1391 aa28.35■■■□□ 2.13
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Ptges3-201ENSMUST00000052798 Duox2A2AQ99 1517 aa28.13■■■□□ 2.09
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Arap1Q4LDD4 1452 aa28.12■■■□□ 2.09
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Ptges3-201ENSMUST00000052798 Setd5Q5XJV7 1441 aa28.06■■■□□ 2.08
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa28.05■■■□□ 2.08
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa28.04■■■□□ 2.08
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Ptges3-201ENSMUST00000052798 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Ankrd26Q811D2 1581 aa27.99■■■□□ 2.07
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Mrc2Q64449 1479 aa27.97■■■□□ 2.07
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa27.96■■■□□ 2.07
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Carmil1Q6EDY6 1374 aa27.95■■■□□ 2.07
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Samd9lQ69Z37 1561 aa27.94■■■□□ 2.06
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Kif21aQ9QXL2 1672 aa27.92■■■□□ 2.06
Ptges3-201ENSMUST00000052798 SynmQ70IV5 1561 aa27.9■■■□□ 2.06
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa27.87■■■□□ 2.05
Ptges3-201ENSMUST00000052798 Crocc2F6XLV1 1638 aa27.87■■■□□ 2.05
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