RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040676.10

Ankrd54-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd54, Length 1,904 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 NischQ80TM9 1593 aa42,05■■■■■ 4,32
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa41,79■■■■■ 4,28
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Abcc9P70170 1546 aa40,88■■■■■ 4,14
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Abcc8B2RUS7 1588 aa40,13■■■■■ 4,02
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rhox8Q6VSS7 320 aa38,1■■■■□ 3,69
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 ScribQ80U72 1612 aa37,67■■■■□ 3,62
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rtl1Q7M732 1744 aa37,49■■■■□ 3,59
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dcaf1Q80TR8 1506 aa37,47■■■■□ 3,59
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kdm5dQ62240 1548 aa36,84■■■■□ 3,49
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa36,8■■■■□ 3,48
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 NacadQ5SWP3 1504 aa36,66■■■■□ 3,46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ccdc180J3QNE4 1664 aa36,61■■■■□ 3,45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Baz1aO88379 1555 aa36,41■■■■□ 3,42
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP36,23■■■■□ 3,39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Crybg2B7ZCC2 1516 aa35,96■■■■□ 3,35
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Sycp2Q9CUU3 1500 aa35,87■■■■□ 3,33
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35,55■■■■□ 3,28
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa35,38■■■■□ 3,25
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 BicraF8VPZ9 1578 aa35,11■■■■□ 3,21
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 HrcG5E8J6 738 aa34,9■■■■□ 3,18
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Trim41Q5NCC3 630 aa34,88■■■■□ 3,17
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa34,71■■■■□ 3,15
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP34,62■■■■□ 3,13
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Synj1Q8CHC4 1574 aa34,36■■■■□ 3,09
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 CftrP26361 1476 aa34,23■■■■□ 3,07
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP34,21■■■■□ 3,07
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34,13■■■■□ 3,05
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cep164Q5DU05 1446 aa34,08■■■■□ 3,05
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Golga3P55937 1487 aa34,07■■■■□ 3,04
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cngb1E1AZ71 1325 aa33,91■■■■□ 3,02
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Top2bQ64511 1612 aa33,83■■■■□ 3,01
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP33,81■■■■□ 3
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa33,77■■■■□ 3
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP33,76■■■■□ 3
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP33,72■■■□□ 2,99
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP33,68■■■□□ 2,98
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa33,66■■■□□ 2,98
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Chic1Q8CBW7 227 aa33,65■■■□□ 2,98
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa33,42■■■□□ 2,94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Fmn1Q05860 1466 aa33,3■■■□□ 2,92
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa33,24■■■□□ 2,91
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Wdr62Q3U3T8 1523 aa33,2■■■□□ 2,91
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Frmpd1A2AKB4 1549 aa33,16■■■□□ 2,9
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gab3Q8BSM5 595 aa33,14■■■□□ 2,9
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP33,1■■■□□ 2,89
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP33,07■■■□□ 2,88
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP33,05■■■□□ 2,88
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ercc6F8VPZ5 1481 aa33,03■■■□□ 2,88
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 TnnQ80Z71 1560 aa32,99■■■□□ 2,87
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa32,84■■■□□ 2,85
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Unc13aQ4KUS2 1712 aa32,82■■■□□ 2,85
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Lamc3Q9R0B6 1581 aa32,8■■■□□ 2,84
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP32,76■■■□□ 2,83
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kif15Q6P9L6 1387 aa32,57■■■□□ 2,8
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cep162Q6ZQ06 1403 aa32,53■■■□□ 2,8
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP32,53■■■□□ 2,8
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP32,44■■■□□ 2,78
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Camsap1A2AHC3 1581 aa32,43■■■□□ 2,78
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Fam135aQ6NS59 1506 aa32,38■■■□□ 2,77
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Npm2Q80W85 207 aa32,28■■■□□ 2,76
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ccdc18Q640L5 1455 aa32,28■■■□□ 2,76
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 NrkQ9R0G8 1455 aa32,28■■■□□ 2,76
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 PtprkP35822 1457 aa32,23■■■□□ 2,75
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Shroom4Q1W617 1475 aa32,2■■■□□ 2,75
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Grin2bQ01097 1482 aa32,16■■■□□ 2,74
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Il27Q8K3I6 234 aa32,16■■■□□ 2,74
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Arhgap35Q91YM2 1499 aa32,15■■■□□ 2,74
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ubl4bQ9CQ84 188 aa32,15■■■□□ 2,74
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cux2P70298 1426 aa32,14■■■□□ 2,74
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Myt1lP97500 1187 aa32,12■■■□□ 2,73
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Map3k1P53349 1493 aa32,02■■■□□ 2,72
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Baz1bQ9Z277 1479 aa31,94■■■□□ 2,7
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP31,9■■■□□ 2,7
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Clip1Q922J3 1391 aa31,88■■■□□ 2,69
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa31,87■■■□□ 2,69
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP31,86■■■□□ 2,69
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Efcab5A0JP43 1406 aa31,84■■■□□ 2,69
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP31,82■■■□□ 2,68
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mier1Q5UAK0 511 aa31,8■■■□□ 2,68
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP31,75■■■□□ 2,67
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Eea1Q8BL66 1411 aa31,75■■■□□ 2,67
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Duox2A2AQ99 1517 aa31,73■■■□□ 2,67
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Arap1Q4LDD4 1452 aa31,66■■■□□ 2,66
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 UbtfP25976 765 aaKnown RBP31,65■■■□□ 2,66
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mrc2Q64449 1479 aa31,63■■■□□ 2,65
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Zeb1Q64318 1117 aa31,63■■■□□ 2,65
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 NefmP08553 848 aa31,61■■■□□ 2,65
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP31,6■■■□□ 2,65
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Setd5Q5XJV7 1441 aa31,59■■■□□ 2,65
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa31,58■■■□□ 2,65
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Erich3F6QRE9 1637 aa31,58■■■□□ 2,65
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Samd9lQ69Z37 1561 aa31,53■■■□□ 2,64
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ankrd26Q811D2 1581 aa31,53■■■□□ 2,64
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Carmil1Q6EDY6 1374 aa31,53■■■□□ 2,64
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa31,51■■■□□ 2,64
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kif21aQ9QXL2 1672 aa31,51■■■□□ 2,63
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa31,5■■■□□ 2,63
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 SynmQ70IV5 1561 aa31,48■■■□□ 2,63
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Crocc2F6XLV1 1638 aa31,47■■■□□ 2,63
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tiam1Q60610 1591 aa31,39■■■□□ 2,62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31,1 ms