RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035673.7

Vhl-201, Transcript of von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vhl, Length 2,792 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vhl-201ENSMUST00000035673 ScribQ80U72 1612 aa32.05■■■□□ 2.72
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Vhl-201ENSMUST00000035673 Kdm5dQ62240 1548 aa31.31■■■□□ 2.6
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Vhl-201ENSMUST00000035673 BicraF8VPZ9 1578 aa29.9■■■□□ 2.38
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Vhl-201ENSMUST00000035673 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa28.51■■■□□ 2.15
Vhl-201ENSMUST00000035673 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa28.34■■■□□ 2.13
Vhl-201ENSMUST00000035673 Frmpd1A2AKB4 1549 aa28.24■■■□□ 2.11
Vhl-201ENSMUST00000035673 Wdr62Q3U3T8 1523 aa28.23■■■□□ 2.11
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Vhl-201ENSMUST00000035673 Fmn1Q05860 1466 aa28.17■■■□□ 2.1
Vhl-201ENSMUST00000035673 Ercc6F8VPZ5 1481 aa28.15■■■□□ 2.1
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Vhl-201ENSMUST00000035673 Unc13aQ4KUS2 1712 aa27.96■■■□□ 2.07
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Vhl-201ENSMUST00000035673 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
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Vhl-201ENSMUST00000035673 Lamc3Q9R0B6 1581 aa27.81■■■□□ 2.04
Vhl-201ENSMUST00000035673 Kif15Q6P9L6 1387 aa27.74■■■□□ 2.03
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Vhl-201ENSMUST00000035673 Ccdc18Q640L5 1455 aa27.42■■□□□ 1.98
Vhl-201ENSMUST00000035673 Cux2P70298 1426 aa27.4■■□□□ 1.98
Vhl-201ENSMUST00000035673 Myt1lP97500 1187 aa27.36■■□□□ 1.97
Vhl-201ENSMUST00000035673 PtprkP35822 1457 aa27.36■■□□□ 1.97
Vhl-201ENSMUST00000035673 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
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Vhl-201ENSMUST00000035673 Shroom4Q1W617 1475 aa27.26■■□□□ 1.95
Vhl-201ENSMUST00000035673 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
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Vhl-201ENSMUST00000035673 Arhgap35Q91YM2 1499 aa27.2■■□□□ 1.95
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Vhl-201ENSMUST00000035673 Clip1Q922J3 1391 aa26.98■■□□□ 1.91
Vhl-201ENSMUST00000035673 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa26.98■■□□□ 1.91
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Vhl-201ENSMUST00000035673 Samd9lQ69Z37 1561 aa26.79■■□□□ 1.88
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Vhl-201ENSMUST00000035673 Arap1Q4LDD4 1452 aa26.75■■□□□ 1.87
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Vhl-201ENSMUST00000035673 SynmQ70IV5 1561 aa26.7■■□□□ 1.86
Vhl-201ENSMUST00000035673 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa26.69■■□□□ 1.86
Vhl-201ENSMUST00000035673 Ankrd26Q811D2 1581 aa26.67■■□□□ 1.86
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Vhl-201ENSMUST00000035673 Erich3F6QRE9 1637 aa26.63■■□□□ 1.85
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