RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	MICU2	Q8IYU8	434 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CPXM2	Q8N436	756 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	EDA	Q92838	391 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM162A	Q96A26	154 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ISOC1	Q96CN7	298 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	THAP11	Q96EK4	314 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TEX37	Q96LM6	180 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PPM1M	Q96MI6	270 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC32A1	Q9H598	525 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLMP	Q9H6B4	373 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	C3orf18	Q9UK00	162 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516		A0A1B0GTL3	188 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PLOD2	O00469	737 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRRG1	O14668	218 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRIM16	O95361	564 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CD160	O95971	181 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	S100A3	P33764	101 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	MTHFR	P42898	656 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	RXRG	P48443	463 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	HSPA7	P48741	367 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLDN8	P56748	225 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	RAB33A	Q14088	237 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	KIAA0040	Q15053	153 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	USP45	Q70EL2	814 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	NXPE1	Q8N323	547 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	SETD9	Q8NE22	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	GAB3	Q8WWW8	586 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	USP7	Q93009	1102 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMBIM1	Q969X1	311 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	IGSF21	Q96ID5	467 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF583	Q96ND8	569 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM74	Q96NL1	305 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	INVS	Q9Y283	1065 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PTPRS	Q13332	1948 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	EVPLL	A8MZ36	301 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516		C9JVG2	144 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	QSOX1	O00391	747 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CXCR6	O00574	342 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	WNT9A	O14904	365 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CPNE6	O95741	557 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ALPL	P05186	524 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	PGR	P06401	933 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	CSK	P41240	450 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRPC1	P48995	793 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	AP1S2	P56377	157 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ABHD18	Q0P651	414 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	KCNC3	Q14003	757 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	EML3	Q32P44	896 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	LINGO4	Q6UY18	593 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-223	ENST00000588516	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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