RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 RAB28P51157 221 aa31.18■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 TPSAB1Q15661 275 aa31.18■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 SLC5A12Q1EHB4 618 aa31.18■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 PTCHD3Q3KNS1 767 aa31.18■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 LRRC8BQ6P9F7 803 aa31.18■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 UNC5DQ6UXZ4 953 aa31.18■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 PRELID2Q8N945 189 aa31.18■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 TCFL5Q9UL49 500 aa31.18■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 K7EM74 188 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 DNAJB5O75953 348 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 OR2B3O76000 313 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 SLCO2B1O94956 709 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 KLRB1Q12918 225 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 KYNUQ16719 465 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 DEFB110Q30KQ9 67 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 FAM198BQ6UWH4 519 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 ASB18Q6ZVZ8 466 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 LRRC6Q86X45 466 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 OTUD6BQ8N6M0 293 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 GSDMBQ8TAX9 411 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 PANX3Q96QZ0 392 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 KIFC1Q9BW19 673 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 TRIM55Q9BYV6 548 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 P2RY12Q9H244 342 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 SYBUQ9NX95 663 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 CAPN1P07384 714 aa31.16■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 AGXTP21549 392 aa31.16■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 C9J4A7 227 aa31.15■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 KPNA5O15131 536 aa31.15■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 VAPBO95292 243 aa31.15■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 GABRA4P48169 554 aa31.15■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 CPZQ66K79 652 aa31.15■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa31.15■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 MFSD3Q96ES6 412 aa31.15■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 ARGFXA6NJG6 315 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 HCRTR1O43613 425 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 CHAF1BQ13112 559 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 NCF4Q15080 339 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 FAM69BQ5VUD6 431 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 MRNIPQ6NTE8 343 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 CES3Q6UWW8 571 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 TEX19Q8NA77 164 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 LINC01555Q8NAE3 123 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 SLC22A18Q96BI1 424 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 MENTQ9BUN1 341 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 ING2Q9H160 280 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 ACSS2Q9NR19 701 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 CIDEBQ9UHD4 219 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 SOX13Q9UN79 622 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 SEC16AO15027 2179 aa31.14■■■□□ 2.58
TTC7B-202ENST00000553948 H3BMH7 237 aa31.13■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 CD9P21926 228 aa31.13■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 ARNTP27540 789 aa31.13■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 PTGIRP43119 386 aa31.13■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 VPS41P49754 854 aa31.13■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 TERF1P54274 439 aa31.13■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 SARNPP82979 210 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 TTC23LQ6PF05 361 aa31.13■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 OTOAQ7RTW8 1153 aa31.13■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 DNAJC22Q8N4W6 341 aa31.13■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 PLCL2Q9UPR0 1127 aa31.13■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 GPS1Q13098 491 aa31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 GRB7Q14451 532 aa31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 KCNJ11Q14654 390 aa31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 COLEC12Q5KU26 742 aa31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 RHBDD2Q6NTF9 364 aa31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 FAM20CQ8IXL6 584 aa31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 OR2L8Q8NGY9 312 aa31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 IL17FQ96PD4 163 aa31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 C17orf62Q9BQA9 187 aa31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 DHRS4Q9BTZ2 278 aa31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 IRAK4Q9NWZ3 460 aa31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 SLC39A10Q9ULF5 831 aa31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 PADI2Q9Y2J8 665 aa31.12■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 PFDN6O15212 129 aa31.11■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 CCL11P51671 97 aa31.11■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 TLDC1Q6P9B6 456 aa31.11■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 SLC25A23Q9BV35 468 aa31.11■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa31.11■■■□□ 2.57
TTC7B-202ENST00000553948 SRPK3Q9UPE1 567 aa31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms