RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PCSK5	Q92824	1860 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	KDM1A	O60341	852 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CEACAM4	O75871	244 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	TMEM63A	O94886	807 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	AGXT	P21549	392 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	AOAH	P28039	575 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PKLR	P30613	574 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	KCNJ1	P48048	391 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	NPY2R	P49146	381 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	MLLT10	P55197	1068 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CRADD	P78560	199 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	KIR2DS3	Q14952	304 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	NCF4	Q15080	339 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	KRT222	Q8N1A0	295 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	P2RY12	Q9H244	342 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PLAA	Q9Y263	795 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	OR2B3	O76000	313 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	SLCO2B1	O94956	709 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	FGG	P02679	453 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	NMBR	P28336	390 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CD97	P48960	835 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TTPA	P49638	278 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	RAB28	P51157	221 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	GBP5	Q96PP8	586 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	IL22	Q9GZX6	179 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936		C9J4A7	227 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	AP3B1	O00203	1094 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	APOA4	P06727	396 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CD9	P21926	228 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	13.94	□□□□□ -0.18	9e-7	■■■■■ 32.6
CS-229	ENST00000551936	SSPN	Q14714	243 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	C1orf189	Q5VU69	101 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	MED25	Q71SY5	747 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	IL17F	Q96PD4	163 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	KIFC1	Q9BW19	673 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	BFAR	Q9NZS9	450 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	RASGRF2	O14827	1237 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	ZNF185	O15231	689 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	RPN2	P04844	631 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	CCDC175	P0C221	793 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TPSB2	P20231	275 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	MAG	P20916	626 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	MGAT1	P26572	445 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	ARNT	P27540	789 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	GCGR	P47871	477 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	PGD	P52209	483 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	TPSAB1	Q15661	275 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	NADK2	Q4G0N4	442 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	FCRL6	Q6DN72	434 aa		13.93	□□□□□ -0.18

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