RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502575.1

PDE4D-209, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-209ENST00000502575 PKP3Q9Y446 797 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ZGRF1Q86YA3 2104 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ITPR2Q14571 2701 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ANXA9O76027 345 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SRP72O76094 671 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 KIAA0754O94854 1291 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 FTCDO95954 541 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 VCLP18206 1134 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PTPN7P35236 360 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 STAT5AP42229 794 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 HALP42357 657 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 VAV2P52735 878 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 POLE2P56282 527 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 RWDD2BP57060 319 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CDC20Q12834 499 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ITGA9Q13797 1035 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 COLEC12Q5KU26 742 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 METRNLQ641Q3 311 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 BORAQ6PGQ7 559 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PRSS42Q7Z5A4 293 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 AVL9Q8NBF6 648 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 DTX3LQ8TDB6 740 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 STARD8Q92502 1023 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SLC45A3Q96JT2 553 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SPATA13Q96N96 652 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 RUFY1Q96T51 708 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ASB8Q9H765 288 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SCN3AQ9NY46 2000 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CCDC78A2IDD5 438 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CCDC66A2RUB6 948 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 AGAP14A8MT82 685 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 BTNL10A8MVZ5 291 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 LDB2O43679 373 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 METTL18O95568 372 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 POLBP06746 335 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 EBLN1P0CF75 366 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 FOLR1P15328 257 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 TPH1P17752 444 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 MSH3P20585 1137 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 DLSTP36957 453 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ABHD18Q0P651 414 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 KCNAB2Q13303 367 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 KCNMB1Q16558 191 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 DEFB109BQ30KR1 87 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SLC6A19Q695T7 634 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 KIAA1328Q86T90 577 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 TMEM135Q86UB9 458 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 RASGRP3Q8IV61 690 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 NXPE1Q8N323 547 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 C12orf66Q96MD2 445 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 MAP3K3Q99759 626 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ZPBPQ9BS86 351 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CRLS1Q9UJA2 301 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CROTQ9UKG9 612 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 LRBAP50851 2863 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 OR5K3A6NET4 321 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 MGAT4DA6NG13 374 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 C2orf81A6NN90 581 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SUV39H1O43463 412 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PPFIA2O75334 1257 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SPAG6O75602 509 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 TJP3O95049 919 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 FGF5P12034 268 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 NELFEP18615 380 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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