RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 LINC01555Q8NAE3 123 aa22.63■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 SLC25A18Q9H1K4 315 aa22.63■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 SERTAD3Q9UJW9 196 aa22.63■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.63■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 SEC16AO15027 2179 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 A0A0J9YY10 115 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 PRKAR1AP10644 381 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 SPTBP11277 2137 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 KCNAB2Q13303 367 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 ZIC1Q15915 447 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 NEPROQ6NW34 567 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 HMGCLL1Q8TB92 370 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 RNF31Q96EP0 1072 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 FAM60AQ9NP50 221 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 ENAMQ9NRM1 1142 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 KCNMB2Q9Y691 235 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM150CB9EJG8 249 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 MEN1O00255 615 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 FKBP9O95302 570 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 RAB40ALP0C0E4 278 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 CD9P21926 228 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 PTPN4P29074 926 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 ITGA1P56199 1179 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 OTOAQ7RTW8 1153 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.61■■□□□ 1.215e-11■■■■■ 61.5
C9orf3-215ENST00000478473 OR2L8Q8NGY9 312 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 SLC22A18Q96BI1 424 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 RASGRF2O14827 1237 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF185O15231 689 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 USP1O94782 785 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 MATN4O95460 622 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 S1PR4O95977 384 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 CAPN1P07384 714 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 FURINP09958 794 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 SYVN1Q86TM6 617 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 DNAJC22Q8N4W6 341 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 RAD51AP1Q96B01 352 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 ACTL8Q9H568 366 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 POLHQ9Y253 713 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 E7EQ34 232 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 KATNA1O75449 491 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 C1orf105O95561 183 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 HBQ1P09105 142 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 PKMP14618 531 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 CCNFP41002 786 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 RPS15P62841 145 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 NFATC3Q12968 1075 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 UGT8Q16880 541 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 DEFB109BQ30KR1 87 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 C16orf46Q6P387 395 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 CASC4Q6P4E1 433 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 TRIM73Q86UV7 250 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 HOOK3Q86VS8 718 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 NLNQ9BYT8 704 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 CHST8Q9H2A9 424 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 KLK4Q9Y5K2 254 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa22.59■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 USP27XA6NNY8 438 aa22.58■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 NIPSNAP2O75323 286 aa22.58■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 CYP2A7P20853 494 aa22.58■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 FMO4P31512 558 aa22.58■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 ERV3-1Q14264 604 aa22.58■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.58■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 MR1Q95460 341 aa22.58■■□□□ 1.21
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms