RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	ROCK1	Q13464	1354 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	RNF103	O00237	685 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	TTI1	O43156	1089 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	RAD51D	O75771	328 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	STAM2	O75886	525 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	DDHD2	O94830	711 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	CELA2A	P08217	269 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PRF1	P14222	555 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	DES	P17661	470 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	TYMP	P19971	482 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	S1PR1	P21453	382 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	IL10	P22301	178 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	LMO1	P25800	156 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	TNFRSF8	P28908	595 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	NPBWR1	P48145	328 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PLCD1	P51178	756 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC12A3	P55017	1021 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	MTCP1	P56278	107 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	EVC	P57679	992 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAF2	Q12933	501 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	CALCRL	Q16602	461 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	IFI44L	Q53G44	452 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	XKR9	Q5GH70	373 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PIP4P1	Q86T03	277 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PIM3	Q86V86	326 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PROX1	Q92786	737 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	CSF3R	Q99062	836 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PKP4	Q99569	1192 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PANK2	Q9BZ23	570 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	DCLK3	Q9C098	648 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	POT1	Q9NUX5	634 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	HPF1	Q9NWY4	346 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	SPG21	Q9NZD8	308 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	APPL1	Q9UKG1	709 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	GRIN2B	Q13224	1484 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1B0GVT2	93 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	CYR61	O00622	381 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	LBP	P18428	481 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	EPOR	P19235	508 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	CD27	P26842	260 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	SSTR2	P30874	369 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC6A6	P31641	620 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	ACVRL1	P37023	503 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PEX5	P50542	639 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	MMP15	P51511	669 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	SYT14P1	Q58G82	188 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	GRTP1	Q5TC63	336 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	TRNP1	Q6NT89	227 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	TAF4B	Q92750	862 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	C5orf30	Q96GV9	206 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	RUFY1	Q96T51	708 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PCYT2	Q99447	389 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	NEURL2	Q9BR09	285 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	GKN1	Q9NS71	199 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBBP4-208	ENST00000463378	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		5.67	□□□□□ -1.5

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