RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 SYTL3Q4VX76 610 aa22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 VRK3Q8IV63 474 aa22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 CPT1BQ92523 772 aa22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 MR1Q95460 341 aa22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 CHST8Q9H2A9 424 aa22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM60AQ9NP50 221 aa22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 BFARQ9NZS9 450 aa22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 SERTAD3Q9UJW9 196 aa22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 SPTBP11277 2137 aa22.79■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 MAP3K7O43318 606 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 WISP1O95388 367 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 UGT2B7P16662 529 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 AOAHP28039 575 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 NMBRP28336 390 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 RPS18P62269 152 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 RPS15P62841 145 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 CDK16Q00536 496 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 HSPA14Q0VDF9 509 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 ZIC1Q15915 447 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 TENM4Q6N022 2769 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 DSELQ8IZU8 1212 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 ASZ1Q8WWH4 475 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 KIFC1Q9BW19 673 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 P2RY12Q9H244 342 aa22.78■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 SLCO2B1O94956 709 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 TPSB2P20231 275 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 GABRA4P48169 554 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 TTPAP49638 278 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 TPSAB1Q15661 275 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 UGT8Q16880 541 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 SYVN1Q86TM6 617 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM73Q86UV7 250 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 KRT222Q8N1A0 295 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 SEC14L1Q92503 715 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 TCTN2Q96GX1 697 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.77■■□□□ 1.24
PPP1CC-211ENST00000620030 CAPN1P07384 714 aa22.76■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 RAB40ALP0C0E4 278 aa22.76■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 MGAT1P26572 445 aa22.76■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 ARNTP27540 789 aa22.76■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 KYNUQ16719 465 aa22.76■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.76■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 CLIP3Q96DZ5 547 aa22.76■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 MENTQ9BUN1 341 aa22.76■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM4Q9C037 500 aa22.76■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 SEC16AO15027 2179 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 H3BMH7 237 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 HCRTR1O43613 425 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 CYP2A7P20853 494 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 MAGEA6P43360 314 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 PMS2P54278 862 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 ITGA1P56199 1179 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 KCNC4Q03721 635 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 GRB7Q14451 532 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 HOOK3Q86VS8 718 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 MPP5Q8N3R9 675 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 THAP4Q8WY91 577 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 MFSD3Q96ES6 412 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 SYBUQ9NX95 663 aa22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 A0A0J9YY10 115 aa22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 E7EQ34 232 aa22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 K7EM74 188 aa22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF749O43361 778 aa22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 KDM1AO60341 852 aa22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 APOA4P06727 396 aa22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 PKLRP30613 574 aa22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 CSRP3P50461 194 aa22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 IL10RAQ13651 578 aa22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 KCNJ11Q14654 390 aa22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 KIR2DS3Q14952 304 aa22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC5A12Q1EHB4 618 aa22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 TTC27Q6P3X3 843 aa22.74■■□□□ 1.23
PPP1CC-211ENST00000620030 CES3Q6UWW8 571 aa22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms