RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	CD101	Q93033	1021 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM143	Q96AN5	459 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	TESC	Q96BS2	214 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	TECTB	Q96PL2	329 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CEP41	Q9BYV8	373 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	RNF208	Q9H0X6	261 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	P2RY12	Q9H244	342 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CLUH	O75153	1309 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	NRCAM	Q92823	1304 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	PASK	Q96RG2	1323 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	TRBC2	A0A5B9	178 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CES2	O00748	559 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	KLK10	O43240	276 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	AQP9	O43315	295 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ACTL6B	O94805	426 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	MOCS3	O95396	460 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	MT-ND2	P03891	347 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	LYN	P07948	512 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	RBP1	P09455	135 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	FUT1	P19526	365 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	RAB3A	P20336	220 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ATP6V1B2	P21281	511 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ADH6	P28332	368 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	PBX3	P40426	434 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	EPHA5	P54756	1037 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CDH8	P55286	799 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CDH15	P55291	814 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	NRG3	P56975	720 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CALCRL	Q16602	461 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC36A3	Q495N2	470 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	LRRC66	Q68CR7	880 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD46	Q86W74	232 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	FBXW5	Q969U6	566 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	POFUT1	Q9H488	388 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CDH7	Q9ULB5	785 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CLCA1	A8K7I4	914 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	LGALS8	O00214	317 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	RGS13	O14921	159 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	USP12	O75317	370 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	GSR	P00390	522 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	PGK2	P07205	417 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	SPATA31D3	P0C874	917 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	THRA	P10827	490 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	PTGS1	P23219	599 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	DGKQ	P52824	942 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ERVK-25	P63136	954 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	PTH1R	Q03431	593 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC6	Q16204	474 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ZPBP2	Q6X784	338 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM17	Q86X19	198 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	HPS6	Q86YV9	775 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	FIBCD1	Q8N539	461 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	NECAB1	Q8N987	351 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	GLMP	Q8WWB7	406 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ALG14	Q96F25	216 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	DTD2	Q96FN9	168 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	BEX2	Q9BXY8	128 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	3.81	□□□□□ -1.8
CNOT2-231	ENST00000551483	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		3.81	□□□□□ -1.8

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