RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 APOA4P06727 396 aa18.12■□□□□ 0.49
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SH3BP2-218ENST00000511185 PAMP19021 973 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
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SH3BP2-218ENST00000511185 C2orf54Q08AI8 447 aa18.09■□□□□ 0.49
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZIC1Q15915 447 aa18.09■□□□□ 0.49
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SH3BP2-218ENST00000511185 BBS9Q3SYG4 887 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 UNC5DQ6UXZ4 953 aa18.09■□□□□ 0.49
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