RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 COMMD4Q9H0A8 199 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 MUC13Q9H3R2 512 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D24Q9ULP9 559 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF208O43345 1280 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 TGFB1P01137 390 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 VLDLRP98155 873 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC57Q8N9N7 239 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 COPS4Q9BT78 406 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 IFT46Q9NQC8 304 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 WNT9AO14904 365 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 SCELO95171 688 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 PTGIRP43119 386 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 RASSF5Q8WWW0 418 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ADAP2Q9NPF8 381 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 GMEB2Q9UKD1 530 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 PLK4O00444 970 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 PCDH7O60245 1069 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 ADH5P11766 374 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 MFSD5Q6N075 450 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 AKAP14Q86UN6 197 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMDEC1O15204 470 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 TAS2R39P59534 338 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 PTP4A2Q12974 167 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 IFI44LQ53G44 452 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 FEM1AQ9BSK4 669 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 DUSP26Q9BV47 211 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 LCA5LO95447 670 aa21.97■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 UBE2J2Q8N2K1 259 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0X1KG70 313 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 E7ENX8 843 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 WRBO00258 174 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 NIPSNAP2O75323 286 aa21.97■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 MBLAC2Q68D91 279 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 OSBPL2Q9H1P3 480 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 SUV39H2Q9H5I1 410 aa21.97■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 DHFRP00374 187 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 SLC10A7Q0GE19 358 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 USP30Q70CQ3 517 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 CPNE8Q86YQ8 564 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 PHC3Q8NDX5 983 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 OR5AK3PQ8NH89 298 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 COQ8BQ96D53 544 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 CCR8P51685 355 aa21.96■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 SWI5Q1ZZU3 235 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 KCTD8Q6ZWB6 473 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 RFKQ969G6 155 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 TRPV5Q9NQA5 729 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 NPHS1O60500 1241 aa21.96■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF311Q5JNZ3 666 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 PHF19Q5T6S3 580 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 OR6K6Q8NGW6 343 aa21.96■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 SGCBQ16585 318 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 GJD3Q8N144 294 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 FITM2Q8N6M3 262 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 OR2L3Q8NG85 312 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 ANKHQ9HCJ1 492 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 YIPF1Q9Y548 306 aa21.96■■□□□ 1.11
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