RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228515.5

CSRNP2-201, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRNP2, Length 4,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-201ENST00000228515 SDC2P34741 201 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 BORCS6Q96GS4 357 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 KCNA7Q96RP8 456 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 CCL16O15467 120 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 NT5EP21589 574 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 TRPV1Q8NER1 839 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 RELTQ969Z4 430 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 C8orf48Q96LL4 319 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 PREBQ9HCU5 417 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 BNC1Q01954 994 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 ARMC5Q96C12 935 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 BCO2Q9BYV7 579 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 TSPAN9O75954 239 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 SEMA3DO95025 777 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 SELPP16109 830 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 CD247P20963 164 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 KCNQ1P51787 676 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 RAB25P57735 213 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 LAPTM4AQ15012 233 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 COLEC12Q5KU26 742 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 NEK5Q6P3R8 708 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 SNX33Q8WV41 574 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 C12orf42Q96LP6 360 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 TOR3AQ9H497 397 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 FABP12A6NFH5 140 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 TGFB1P01137 390 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNF24P17028 368 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 IDSP22304 550 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 GMFBP60983 142 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 NFKB2Q00653 900 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 ARHGAP1Q07960 439 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 TIGD6Q17RP2 521 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 GAL3ST1Q99999 423 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 MCIDASD6RGH6 385 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 SYN3O14994 580 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 GMFGO60234 142 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 ADH1CP00326 375 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 GMPRP36959 345 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 HNMTP50135 292 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 ALDH3A2P51648 485 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNF563Q8TA94 476 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 TMEM203Q969S6 136 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 MBD2Q9UBB5 411 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 SNX7Q9UNH6 387 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRNP2-201ENST00000228515 SLIT3O75094 1523 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 DNTTP04053 509 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 IGFBP4P22692 258 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 PDSS2Q86YH6 399 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 STON2Q8WXE9 905 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 SEC14L1Q92503 715 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.46□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 HAS3O00219 553 aa14.45□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 CDH1P12830 882 aa14.45□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 SCNN1AP37088 669 aa14.45□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 DIO3P55073 304 aa14.45□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CSRNP2-201ENST00000228515 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms