RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 ZSCAN12O43309 604 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 SLCO2B1O94956 709 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 TPBGLP0DKB5 382 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 ITGB6P18564 788 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 NMBRP28336 390 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 CRADDP78560 199 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 LRRC6Q86X45 466 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 GALNT6Q8NCL4 622 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 OR5AR1Q8NGP9 310 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 ASZ1Q8WWH4 475 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 PPM1MQ96MI6 270 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 PADI1Q9ULC6 663 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 ASF1AQ9Y294 204 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 MLNP12872 115 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 F8A1P23610 371 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 MGAT1P26572 445 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 SHMT2P34897 504 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 ARL4DP49703 201 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 MCUQ8NE86 351 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 MS4A14Q96JA4 679 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 LRFN5Q96NI6 719 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 HGH1Q9BTY7 390 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 ADNPQ9H2P0 1102 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 LHX9Q9NQ69 397 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 KCND1Q9NSA2 647 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 SYBUQ9NX95 663 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 OR6C2Q9NZP2 312 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa22.71■■□□□ 1.23
C9orf3-215ENST00000478473 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 C2orf74A8MZ97 194 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 NKX2-8O15522 239 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 KRT14P02533 472 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 CDH3P22223 829 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 AOAHP28039 575 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 ADARP55265 1226 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 CDC20Q12834 499 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 GPS1Q13098 491 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 PRKG2Q13237 762 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 TYSND1Q2T9J0 566 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 BORAQ6PGQ7 559 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 SLC35F6Q8N357 371 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 STARD8Q92502 1023 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 CPT1BQ92523 772 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 MFSD3Q96ES6 412 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 TCF12Q99081 682 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 NRTNQ99748 197 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 STARD5Q9NSY2 213 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 TUBD1Q9UJT1 453 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 KCND3Q9UK17 655 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 CROTQ9UKG9 612 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa22.7■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 B8ZZF3 427 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 C21orf140B9A014 251 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 CCNYL3P0C7X3 344 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 SYTL3Q4VX76 610 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF789Q5FWF6 425 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 COG1Q8WTW3 980 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 MENTQ9BUN1 341 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 MAGEB16A2A368 324 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 GSAPA4D1B5 854 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 KDM1AO60341 852 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 ST6GAL1P15907 406 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 DLSTP36957 453 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 MAGEA3P43357 314 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 FNTAP49354 379 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 BRD3Q15059 726 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 GPR19Q15760 415 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 SPESP1Q6UW49 350 aa22.68■■□□□ 1.22
C9orf3-215ENST00000478473 UNC5DQ6UXZ4 953 aa22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms