RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D21Q8IYX1 336 aa19.64■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 CARFQ8N187 725 aa19.64■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT222Q8N1A0 295 aa19.64■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 PDLIM2Q96JY6 352 aa19.64■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC12A9Q9BXP2 914 aa19.64■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 FGF21Q9NSA1 209 aa19.64■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SOHLH2Q9NX45 425 aa19.64■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 ICKQ9UPZ9 632 aa19.64■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA8KD6RF30 607 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA8TH3BQL2 631 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA8MH3BSY2 632 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 TIAF1O95411 115 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 APOA4P06727 396 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 FNTAP49354 379 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR19Q15760 415 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 TMTC4Q5T4D3 741 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 VRK3Q8IV63 474 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC22A15Q8IZD6 547 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 MCUQ8NE86 351 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 GRK7Q8WTQ7 553 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 ASZ1Q8WWH4 475 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 EXTL1Q92935 676 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 P2RY12Q9H244 342 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 C1GALT1Q9NS00 363 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SAMD15Q9P1V8 674 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 POLG2Q9UHN1 485 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 GNPTGQ9UJJ9 305 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 BTRCQ9Y297 605 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 C2orf74A8MZ97 194 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 C1QL1O75973 258 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 ITGB2P05107 769 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 MLNP12872 115 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SHMT2P34897 504 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 STAT5AP42229 794 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 TUBB4BP68371 445 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 TUBB2AQ13885 445 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 LINC00303Q3SY05 128 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 MRNIPQ6NTE8 343 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC6Q86X45 466 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 OR5K2Q8NHB8 316 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC45A3Q96JT2 553 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SERPINB12Q96P63 405 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 EFHD1Q9BUP0 239 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 TUBB2BQ9BVA1 445 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 ACTR10Q9NZ32 417 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 IL17BQ9UHF5 180 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 CDYLQ9Y232 598 aa19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SDR42E2A6NKP2 422 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 GPC4O75487 556 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 TPBGLP0DKB5 382 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 ST6GAL1P15907 406 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 TCP1P17987 556 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 AOAHP28039 575 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 GNG11P61952 73 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 TMED2Q15363 201 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 ARMC3Q5W041 872 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 UNC5AQ6ZN44 842 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 FCRL4Q96PJ5 515 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 PANX3Q96QZ0 392 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 PITPNM3Q9BZ71 974 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SEMA4CQ9C0C4 833 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 KLHL25Q9H0H3 589 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 PLAGL1Q9UM63 463 aa19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 PIPSLA2A3N6 862 aa19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 NKX2-8O15522 239 aa19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 PVRP15151 417 aa19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 PAMP19021 973 aa19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 DLSTP36957 453 aa19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 C19orf57Q0VDD7 668 aa19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 ABRQ12979 859 aa19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R7Q15435 360 aa19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 TBR1Q16650 682 aa19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 TYSND1Q2T9J0 566 aa19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 CFAP61Q8NHU2 1237 aa19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 CROTQ9UKG9 612 aa19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 PYCARDQ9ULZ3 195 aa19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa19.59■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 KDM1AO60341 852 aa19.59■□□□□ 0.73
ANKRD39-201ENST00000393537 SLCO2B1O94956 709 aa19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms