RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234142.9

GREB1-201, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GREB1, Length 8,444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-201ENST00000234142 ERLEC1Q96DZ1 483 aa11.66□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 BPGMP07738 259 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 ABCG1P45844 678 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 CAPZA1P52907 286 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 MFSD3Q96ES6 412 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa11.66□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 IFNA1P01562 189 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 IFNA10P01566 189 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 IFNA4P05014 189 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 SPARCP09486 303 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 SLC1A5Q15758 541 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 TIGD6Q17RP2 521 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.66□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 CDT1Q9H211 546 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 NINQ8N4C6 2090 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 PPATQ06203 517 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 TMEM119Q4V9L6 283 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 ATAT1Q5SQI0 421 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 ZER1Q7Z7L7 766 aa11.66□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 GIMAP5Q96F15 307 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.66□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 SLC26A9Q7LBE3 791 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 GALNT15Q8N3T1 639 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 OXR1Q8N573 874 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 GSTCDQ8NEC7 633 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.541e-7■■■□□ 15.7
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GREB1-201ENST00000234142 OR1F1O43749 312 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 GNSP15586 552 aa11.66□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 BBS12Q6ZW61 710 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 HTATIP2Q9BUP3 242 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 ABCG8Q9H221 673 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 CXorf21Q9HAI6 301 aa11.66□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 SCDO00767 359 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 COL6A1P12109 1028 aa11.66□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 CRISP3P54108 245 aa11.66□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 GNMTQ14749 295 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 TPSAB1Q15661 275 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 HECTD2Q5U5R9 776 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 XKRXQ6PP77 449 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 COMMD3Q9UBI1 195 aa11.66□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 USP20Q9Y2K6 914 aa11.66□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 OR5B12Q96R08 314 aa11.65□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.65□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa11.65□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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GREB1-201ENST00000234142 CSN2P05814 226 aa11.65□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 CXCR1P25024 350 aa11.65□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 LCN1P31025 176 aa11.65□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 LCP2Q13094 533 aa11.65□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa11.65□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.65□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 MYNNQ9NPC7 610 aa11.65□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 MYPNQ86TC9 1320 aa11.65□□□□□ -0.54
GREB1-201ENST00000234142 SHBGP04278 402 aa11.65□□□□□ -0.54
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