RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Impdh1P50096 514 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bcl2a1cQ0P538 128 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alg6Q3TAE8 507 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 G2e3Q5RJY2 716 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eps15l1Q60902 907 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bcl2l1Q64373 233 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc8eQ66JT1 795 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B3gnt5Q8BGY6 376 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4931406P16RikQ8C5X1 1059 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc17Q8CE13 565 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rdh13Q8CEE7 334 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Batf2Q8R1H8 277 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdzd3Q99MJ6 498 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd61Q9CQM6 421 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cmtm6Q9CZ69 183 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gbe1Q9D6Y9 702 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AcadsbQ9DBL1 432 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Jam2Q9JI59 298 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bdp1Q571C7 2467 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sppl2cA2A6C4 690 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pnldc1B2RXZ1 531 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10477F6SW83 55 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tpst1O70281 370 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt1P04104 637 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RhoP15409 348 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnj2P35561 428 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Faf1P54731 649 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr2iP60898 125 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tuba4aP68368 448 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtscP97821 462 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbp1Q00915 135 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Flot2Q60634 428 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Amigo2Q80ZD9 519 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrch3Q8BVU0 778 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmc7Q8C428 726 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab15Q8K386 212 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stk32cQ8QZV4 488 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufs1Q91VD9 727 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nuf2Q99P69 463 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D5Y0 588 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Armc1Q9D7A8 282 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2bfmQ9DAB5 224 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh17Q9R100 827 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11758A2BEI6 360 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11757A2BEI8 360 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gbp4A4UUI3 631 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifit3bE9PV48 403 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina3kP07759 418 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc7a2P18581 657 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 InaP46660 501 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ErfP70459 551 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab33aP97950 237 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrfn1Q2WF71 766 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp4b1Q64462 511 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lpcat4Q6NVG1 524 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrtm3Q8BZ81 582 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cstf2tQ8C7E9 632 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pi4k2bQ8CBQ5 469 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Micu1Q8VCX5 477 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dio3Q91ZI8 304 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nrif1Q923B3 828 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcoln1Q99J21 580 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pinx1Q9CZX5 332 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PudpQ9D5U5 234 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndst3Q9EQH7 873 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr63Q9EQQ3 425 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc28a3Q9ERH8 703 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifi30Q9ESY9 248 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pla2g2fQ9QZT4 168 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adam23Q9R1V7 829 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm28363A0A087WQW2 129 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttll9A2APC3 461 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr742A2RTP5 311 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3752A6NAT4 150 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r120E9PX34 856 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17175E9Q528 179 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm16427J3QN52 483 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C1qbP14106 253 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pim3P58750 326 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pgap2Q3TQR0 254 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc58Q3UGP9 366 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppm1hQ3UYC0 513 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Jak3Q62137 1100 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zzz3Q6KAQ7 910 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef38Q80VK6 770 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps50Q8CI71 964 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gin1Q8K259 518 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp45Q8K387 813 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mmgt2Q8R3L0 123 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr74Q8VCG3 384 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nrbf2Q8VCQ3 287 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gramd1aQ8VEF1 722 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rsph1Q8VIG3 301 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mta3Q924K8 591 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhrs4Q99LB2 279 aa12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpn2Q9DBG6 631 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smok1Q9QYZ4 484 aa12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.9 ms