Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gm10477F6SW83 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gm10477F6SW83 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Gm10477F6SW83 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gm10477F6SW83 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Gm10477F6SW83 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gm10477F6SW83 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Gm10477F6SW83 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gm10477F6SW83 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gm10477F6SW83 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm10477F6SW83 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm10477F6SW83 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm10477F6SW83 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm10477F6SW83 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm10477F6SW83 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm10477F6SW83 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm10477F6SW83 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm10477F6SW83 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm10477F6SW83 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm10477F6SW83 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm10477F6SW83 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gm10477F6SW83 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm10477F6SW83 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm10477F6SW83 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm10477F6SW83 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm10477F6SW83 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm10477F6SW83 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm10477F6SW83 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm10477F6SW83 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm10477F6SW83 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gm10477F6SW83 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm10477F6SW83 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm10477F6SW83 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm10477F6SW83 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm10477F6SW83 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm10477F6SW83 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm10477F6SW83 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm10477F6SW83 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm10477F6SW83 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm10477F6SW83 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm10477F6SW83 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm10477F6SW83 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm10477F6SW83 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm10477F6SW83 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm10477F6SW83 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm10477F6SW83 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm10477F6SW83 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm10477F6SW83 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm10477F6SW83 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm10477F6SW83 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm10477F6SW83 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm10477F6SW83 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm10477F6SW83 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm10477F6SW83 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm10477F6SW83 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm10477F6SW83 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm10477F6SW83 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm10477F6SW83 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm10477F6SW83 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm10477F6SW83 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm10477F6SW83 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm10477F6SW83 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm10477F6SW83 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm10477F6SW83 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm10477F6SW83 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm10477F6SW83 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm10477F6SW83 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm10477F6SW83 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm10477F6SW83 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm10477F6SW83 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm10477F6SW83 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm10477F6SW83 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm10477F6SW83 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm10477F6SW83 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm10477F6SW83 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm10477F6SW83 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm10477F6SW83 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm10477F6SW83 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm10477F6SW83 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm10477F6SW83 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm10477F6SW83 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm10477F6SW83 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm10477F6SW83 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm10477F6SW83 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm10477F6SW83 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm10477F6SW83 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm10477F6SW83 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm10477F6SW83 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm10477F6SW83 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm10477F6SW83 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm10477F6SW83 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm10477F6SW83 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm10477F6SW83 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm10477F6SW83 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm10477F6SW83 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm10477F6SW83 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm10477F6SW83 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm10477F6SW83 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm10477F6SW83 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm10477F6SW83 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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