RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 TGIF1Q15583 401 aa10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 ANKRD22Q5VYY1 191 aa10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 MRNIPQ6NTE8 343 aa10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 LRRC6Q86X45 466 aa10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 LCN9Q8WX39 176 aa10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 SLC41A2Q96JW4 573 aa10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 FERD3LQ96RJ6 166 aa10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 CARD6Q9BX69 1037 aa10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 WDR70Q9NW82 654 aa10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 HRASLS2Q9NWW9 162 aa10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 SAMD15Q9P1V8 674 aa10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 GNPTGQ9UJJ9 305 aa10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 PYCARDQ9ULZ3 195 aa10.76□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 MAGEB16A2A368 324 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 OR6C74A6NCV1 312 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 RAD1O60671 282 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 NDUFS3O75489 264 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 NELFEP18615 380 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP10.75□□□□□ -0.698e-6■■■■■ 30.2
UBXN8-209ENST00000620074 ARNTP27540 789 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 TERF1P54274 439 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 PPP1CAP62136 330 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 RHDQ02161 417 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 FOXM1Q08050 763 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 TMED2Q15363 201 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 PPP1R7Q15435 360 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 ARHGAP40Q5TG30 622 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 CASC4Q6P4E1 433 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 OTUD6BQ8N6M0 293 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 SLCO2A1Q92959 643 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 NKD1Q969G9 470 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 MFSD3Q96ES6 412 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 RUNDC3BQ96NL0 473 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 SERPINB12Q96P63 405 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 PANX3Q96QZ0 392 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 TCF12Q99081 682 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 CTRCQ99895 268 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 HGH1Q9BTY7 390 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 SRMSQ9H3Y6 488 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 APMAPQ9HDC9 416 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 POLG2Q9UHN1 485 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 PILRAQ9UKJ1 303 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 NBEAQ8NFP9 2946 aa10.75□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 CTAGE9A4FU28 777 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 SDR42E2A6NKP2 422 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 KPNA5O15131 536 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 KDM1AO60341 852 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 AVILO75366 819 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 STK17BO94768 372 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 VAPBO95292 243 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 APOA4P06727 396 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 FGF5P12034 268 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 OGNP20774 298 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 ACADLP28330 430 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 CCR7P32248 378 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 SHMT2P34897 504 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 MAGEA3P43357 314 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 ARL4DP49703 201 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 ACY1Q03154 408 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 PTK6Q13882 451 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 MAP7Q14244 749 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 BRD3Q15059 726 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 TYSND1Q2T9J0 566 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 CES3Q6UWW8 571 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 VASH2Q86V25 355 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 AMIGO1Q86WK6 493 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 PPIL6Q8IXY8 311 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 TBC1D21Q8IYX1 336 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 SLC22A15Q8IZD6 547 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 NLGN4XQ8N0W4 816 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 IL22RA1Q8N6P7 574 aa10.74□□□□□ -0.69
UBXN8-209ENST00000620074 NAT8LQ8N9F0 302 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms