RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572905.1

TOM1L1-215, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-215	ENST00000572905	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PTGES	O14684	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	LDB3	O75112	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	WISP2	O76076	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ITGA2	P17301	1181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	AHR	P35869	848 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PSMC4	P43686	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SNTA1	Q13424	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	MUS81	Q96NY9	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	IL25	Q9H293	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TAF1	P21675	1872 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	STX6	O43752	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	OR10H2	O60403	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PDE9A	O76083	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TGDS	O95455	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	CSF2RA	P15509	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	GM2A	P17900	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PSMA3	P25788	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	CDC25C	P30307	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	MMP15	P51511	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PTK6	Q13882	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	BICD1	Q96G01	975 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PSMD14	O00487	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	CLIC2	O15247	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLC7A4	O43246	635 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	GCNT3	O95395	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	KRT19	P08727	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	MCC	P23508	829 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PRKCI	P41743	596 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	LTB	Q06643	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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