RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298537.11

SDCCAG3-201, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDCCAG3, Length 2,314 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-201ENST00000298537 MILR1Q7Z6M3 343 aa25.09■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 KIRREL3Q8IZU9 778 aa25.09■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 RNF148Q8N7C7 305 aa25.09■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 TEX37Q96LM6 180 aa25.09■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa25.09■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 GFYI3L273 518 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 K7EPI3 171 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 FTH1P02794 183 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 ANXA5P08758 320 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 LBPP18428 481 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 PRLHRP49683 370 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 PKNOX1P55347 436 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 ATG10Q9H0Y0 220 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 NUMA1Q14980 2115 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 IGLON5A6NGN9 336 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 LOC730098B7Z3J9 87 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 H3BQ06 376 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 STK16O75716 305 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLCO2B1O94956 709 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 PRR35P0CG20 571 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 CST6Q15828 149 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 AGBL4Q5VU57 503 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 C1orf146Q5VVC0 180 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 XKR5Q6UX68 686 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 SFRP1Q8N474 314 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 KCNV2Q8TDN2 545 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 NUDT8Q8WV74 236 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 ASZ1Q8WWH4 475 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 HDAC8Q9BY41 377 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 ATXN10Q9UBB4 475 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3-201ENST00000298537 A0A1W2PP55 124 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 LILRB5O75023 590 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 CCND1P24385 295 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 HTR4Q13639 388 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 ENPP2Q13822 863 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 DSG4Q86SJ6 1040 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 CXorf40AQ8TE69 158 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 UBTD2Q8WUN7 234 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 MTCH2Q9Y6C9 303 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 DENND4AQ7Z401 1863 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 ATG13O75143 517 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 MPC1LP0DKB6 136 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 NEK5Q6P3R8 708 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 LAYNQ6UX15 382 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 NLRP8Q86W28 1048 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF547Q8IVP9 402 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 ARHGEF33A8MVX0 844 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 OTCP00480 354 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 C8GP07360 202 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 EZRP15311 586 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 ITPKAP23677 461 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 BDKRB1P46663 353 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 PTCHD3Q3KNS1 767 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 SYTL3Q4VX76 610 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 REP15Q6BDI9 236 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 KLK6Q92876 244 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 CDRT15Q96T59 188 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 CCM2Q9BSQ5 444 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLC5A10A0PJK1 596 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 PRAMEF4O60810 478 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 CHEK2O96017 543 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 NAA20P61599 178 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 SGO1Q5FBB7 561 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 CRTC3Q6UUV7 619 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 HIPK4Q8NE63 616 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 LGR4Q9BXB1 951 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 WDR41Q9HAD4 459 aa25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 RCN1Q15293 331 aa25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 C6orf136Q5SQH8 315 aa25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 RETREG3Q86VR2 466 aa25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 SMRP1Q8NCR6 262 aa25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 LRCH3Q96II8 777 aa25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 EFCAB1Q9HAE3 211 aa25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 SLC22A14Q9Y267 594 aa25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 GPR45Q9Y5Y3 372 aa25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 TRPM6Q9BX84 2022 aa25.05■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 PRR23AA6NEV1 266 aa25.04■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 NR5A2O00482 541 aa25.04■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 CIB2O75838 187 aa25.04■■□□□ 1.6
SDCCAG3-201ENST00000298537 MATN4O95460 622 aa25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms