RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585934.1

TRAPPC6A-202, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FERD3LQ96RJ6 166 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ULBP3Q9BZM4 244 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 HRASLS2Q9NWW9 162 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PILRAQ9UKJ1 303 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 OR6C74A6NCV1 312 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 F8W8V4 182 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 OR56A5P0C7T3 313 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LIFP15018 202 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PRKAA1Q13131 559 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RPA4Q13156 261 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 OR4L1Q8NH43 312 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LCN9Q8WX39 176 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KLHL6Q8WZ60 621 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ELMO1Q92556 727 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PEX13Q92968 403 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 WBP1Q96G27 269 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ELMO2Q96JJ3 720 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CD180Q99467 661 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 OR52A5Q9H2C5 316 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ANAPC5Q9UJX4 755 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 JRKLQ9Y4A0 524 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PRSS21Q9Y6M0 314 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 AP3B1O00203 1094 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NELFEP18615 380 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CD151P48509 253 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TUBB3Q13509 450 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 IL11RAQ14626 422 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PCID2Q5JVF3 399 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PCSK4Q6UW60 755 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CERS6Q6ZMG9 384 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ESX1Q8N693 406 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PRELID2Q8N945 189 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 OR4E2Q8NGC2 313 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RNF31Q96EP0 1072 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PBKQ96KB5 322 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZNF778Q96MU6 729 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MAP3K3Q99759 626 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 HGH1Q9BTY7 390 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 IL22Q9GZX6 179 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PDE7BQ9NP56 450 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CATSPERZQ9NTU4 200 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 BFARQ9NZS9 450 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ATMQ13315 3056 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 GSAPA4D1B5 854 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZSCAN12O43309 604 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DLGAP3O95886 979 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 WT1P19544 449 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TPSB2P20231 275 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PDHA2P29803 388 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 VPS41P49754 854 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TERF1P54274 439 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CRADDP78560 199 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ACVR1Q04771 509 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LY6DQ14210 128 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KCNAB1Q14722 419 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 BRD3Q15059 726 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TPSAB1Q15661 275 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KMT5CQ86Y97 462 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 OTUD6BQ8N6M0 293 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SLC41A2Q96JW4 573 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EFHD1Q9BUP0 239 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TSSK1BQ9BXA7 367 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SRMSQ9H3Y6 488 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MVB12BQ9H7P6 319 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SOHLH2Q9NX45 425 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RARRES3Q9UL19 164 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MATN2O00339 956 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 OR1I1O60431 355 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KIAA0754O94854 1291 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ITGB2P05107 769 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EBLN1P0CF75 366 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZNF28P17035 718 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CYP4F2P78329 520 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms