RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 CLCN7P51798 805 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 BIRC2Q13490 618 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 GBX1Q14549 363 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 NR1D2Q14995 579 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 PDZD3Q86UT5 571 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 CTAGE3PQ8IX95 158 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 IFI44Q8TCB0 444 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 RMDN2Q96LZ7 410 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 RHOJQ9H4E5 214 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 UCK1Q9HA47 277 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 TAS2R13Q9NYV9 303 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 TXNDC16Q9P2K2 825 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 DHRS7Q9Y394 339 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 V9GYY5 206 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-210ENST00000533686 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 GIPC1O14908 333 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ZW10O43264 779 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 RFPL3O75679 317 aa16.08■□□□□ 0.16
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PACSIN3-210ENST00000533686 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ACADLP28330 430 aa16.08■□□□□ 0.16
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PACSIN3-210ENST00000533686 GPR3P46089 330 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 E2F1Q01094 437 aa16.08■□□□□ 0.16
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PACSIN3-210ENST00000533686 TTLL9Q3SXZ7 439 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 GRTP1Q5TC63 336 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 HECTD2Q5U5R9 776 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIM48Q8IWZ4 208 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ZBTB2Q8N680 514 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 PPM1NQ8N819 430 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ZFPM2Q8WW38 1151 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 INPP5DQ92835 1189 aa16.08■□□□□ 0.16
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PACSIN3-210ENST00000533686 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 C12orf66Q96MD2 445 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 NDNQ99608 321 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 GALPQ9UBC7 116 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 VWA7Q9Y334 891 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 RIPK2O43353 540 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 FTH1P19P0C7X4 201 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SPRP35270 261 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ABCG1P45844 678 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 KLHL38Q2WGJ6 581 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 PERM1Q5SV97 790 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 VRK3Q8IV63 474 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 GPATCH11Q8N954 259 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 VPS39Q96JC1 886 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 GPR21Q99679 349 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 RBBP8Q99708 897 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 PARD6BQ9BYG5 372 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB21Q9UL25 225 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 LILRA5A6NI73 299 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CBSLP0DN79 551 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 FDXRP22570 491 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CBSP35520 551 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 LIMK2P53671 638 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CDKN2DP55273 166 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 NEK10Q6ZWH5 1172 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.06■□□□□ 0.16
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