RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL33A6NCF5 533 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5K3A6NET4 321 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 IQCF5A8MTL0 148 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 B4E171 279 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA8KD6RF30 607 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA8TH3BQL2 631 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 RASSF9O75901 435 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 WT1P19544 449 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPAN7P41732 249 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 LAMB3Q13751 1172 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 GSE1Q14687 1217 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP40Q5TG30 622 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CERS6Q6ZMG9 384 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 NLRP9Q7RTR0 991 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 DTX1Q86Y01 620 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 ELMO1Q92556 727 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 PEX13Q92968 403 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 KIFC1Q9BW19 673 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 DDA1Q9BW61 102 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS37BQ9H9H4 285 aa18.23■□□□□ 0.51
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SH3BP2-218ENST00000511185 BFARQ9NZS9 450 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 SOX13Q9UN79 622 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa18.23■□□□□ 0.51
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SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT222Q8N1A0 295 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 PHC3Q8NDX5 983 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINB12Q96P63 405 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6C74A6NCV1 312 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 FTH1P02794 183 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 NPY2RP49146 381 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 MC2RQ01718 297 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNAB1Q14722 419 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 SYTL3Q4VX76 610 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM164Q5U3C3 297 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CACHD1Q5VU97 1274 aa18.21■□□□□ 0.51
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SH3BP2-218ENST00000511185 OR52E1Q8NGJ3 308 aa18.21■□□□□ 0.51
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SH3BP2-218ENST00000511185 SGSM3Q96HU1 749 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 FERD3LQ96RJ6 166 aa18.21■□□□□ 0.51
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SH3BP2-218ENST00000511185 RAB33BQ9H082 229 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 EPHA6Q9UF33 1036 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC5A10A0PJK1 596 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 STMND1H3BQB6 276 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 VAPBO95292 243 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 OR56A5P0C7T3 313 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF28P17035 718 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TCP1P17987 556 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CCR7P32248 378 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB15P59190 212 aa18.2■□□□□ 0.5
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SH3BP2-218ENST00000511185 FOXM1Q08050 763 aa18.2■□□□□ 0.5
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SH3BP2-218ENST00000511185 OTUD6BQ8N6M0 293 aa18.2■□□□□ 0.5
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SH3BP2-218ENST00000511185 P2RY12Q9H244 342 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 XKR8Q9H6D3 395 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 HRASLS2Q9NWW9 162 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CDYLQ9Y232 598 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 BTN3A3O00478 584 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 BTN3A1O00481 513 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 BANF1O75531 89 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CD82P27701 267 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ACADLP28330 430 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGEA3P43357 314 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 UCNP55089 124 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 VAC14Q08AM6 782 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 RPA4Q13156 261 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CTSL3PQ5NE16 218 aa18.19■□□□□ 0.5
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