RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIR2DL3P43628 341 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TAZQ16635 292 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZACNQ401N2 412 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF691Q5VV52 312 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYVN1Q86TM6 617 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT73Q86Y46 540 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TIGD4Q8IY51 512 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR7G3Q8NG95 312 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASB15Q8WXK1 588 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC9A7Q96T83 725 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CNPY3Q9BT09 278 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUSP21Q9H596 190 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 LIPT1Q9Y234 373 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASB14A6NK59 587 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 C19orf81C9J6K1 198 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CELF2O95319 508 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 APOC2P02655 101 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF224P0DH78 156 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNFSF8P32971 234 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBP5P82980 135 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF79Q15937 498 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ETFDHQ16134 617 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM60Q495X7 471 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLLU1Q5K131 121 aa6.79□□□□□ -1.32
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CACNA2D3-210ENST00000490478 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.79□□□□□ -1.32
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CACNA2D3-210ENST00000490478 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 EMC1Q8N766 993 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF566Q969W8 418 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ISL2Q96A47 359 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 VAT1Q99536 393 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.79□□□□□ -1.32
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CACNA2D3-210ENST00000490478 REG4Q9BYZ8 158 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ALG5Q9Y673 324 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPP6CO00743 305 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 APOL1O14791 398 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBX3O15119 743 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PMM2O15305 246 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNN4O15554 427 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANGPTL1O95841 491 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDPCPO95876 746 aa6.79□□□□□ -1.32
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CACNA2D3-210ENST00000490478 ACSM4P0C7M7 580 aa6.79□□□□□ -1.32
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CACNA2D3-210ENST00000490478 PIK3CBP42338 1070 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 NRIP1P48552 1158 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 NUBP1P53384 320 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1QTNF8P60827 252 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCINQ13939 588 aa6.79□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 TATDN3Q17R31 274 aa6.79□□□□□ -1.32
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