RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 PROSER1Q86XN7 944 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 RBFAQ8N0V3 343 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 NACC2Q96BF6 587 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 MARCH7Q9H992 704 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 RAB23Q9ULC3 237 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 NRAPQ86VF7 1730 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 RREB1Q92766 1687 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 LOC730098B7Z3J9 87 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 K7ERQ8 282 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CLDN11O75508 207 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC6A2P23975 617 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 KIR3DL1P43629 444 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ST8SIA6P61647 398 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PMS2P3Q13401 168 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 NAE1Q13564 534 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ACOX1Q15067 660 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SETD9Q8NE22 299 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 MCFD2Q8NI22 146 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CEP44Q9C0F1 390 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 DYRK4Q9NR20 520 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 USP3Q9Y6I4 520 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SCAMP1O15126 338 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC22A2O15244 555 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PGLSO95336 258 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP2A7P20853 494 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 INAQ16352 499 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 OR4F3Q6IEY1 312 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF605Q86T29 641 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PIANPQ8IYJ0 282 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TERB1Q8NA31 727 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TSGA13Q96PP4 275 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CORO1BQ9BR76 489 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 NUAK2Q9H093 628 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SNX6Q9UNH7 406 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 MCM3APO60318 1980 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM234BA2RU67 622 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 GABRR2P28476 465 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 GRK3P35626 688 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PRKCZQ05513 592 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SCAPQ12770 1279 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CHIT1Q13231 466 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SERINC3Q13530 473 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TXNDC8Q6A555 127 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 KIAA1191Q96A73 305 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SUSD3Q96L08 255 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 EHD3Q9NZN3 535 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 GLTPD2A6NH11 291 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 RAP2AP10114 183 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CDK4P11802 303 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ARSFP54793 590 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 DEFA1P59665 94 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 DEFA3P59666 94 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SPIBQ01892 262 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 KCNAB2Q13303 367 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ZBTB2Q8N680 514 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A0J9YVX5 310 aa8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms