RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293362.7

PSME3-201, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 3,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-201ENST00000293362 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 NR6A1Q15406 480 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 C16orf89Q6UX73 402 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 Q6ZSR9 355 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 FAM110BQ8TC76 370 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 CHFRQ96EP1 664 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 ASB16Q96NS5 453 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 SAMD11Q96NU1 681 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 S100A14Q9HCY8 104 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 NDE1Q9NXR1 346 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 PRORSD1PA6NEY8 169 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 C5orf67F2Z3F1 127 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 VCLP18206 1134 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 HMOX2P30519 316 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 UBE3AQ05086 875 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 GPR33Q49SQ1 333 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 TIGD2Q4W5G0 525 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 PIGGQ5H8A4 983 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 SFRP1Q8N474 314 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 AP2M1Q96CW1 435 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 LYSMD1Q96S90 227 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 NRTNQ99748 197 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 OPTCQ9UBM4 332 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 PDE10AQ9Y233 779 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 STX16O14662 325 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 SCAMP1O15126 338 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 TSPAN6O43657 245 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 ADH1CP00326 375 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 PSMC3P17980 439 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 MSH3P20585 1137 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 PEX2P28328 305 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 PDHA2P29803 388 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 PRDX6P30041 224 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 DGKQP52824 942 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 SATB1Q01826 763 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 PTGR1Q14914 329 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 ZNF805Q5CZA5 627 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 MACC1Q6ZN28 852 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 MIER2Q8N344 545 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 CEP44Q9C0F1 390 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 USP22Q9UPT9 525 aa9.96□□□□□ -0.81
PSME3-201ENST00000293362 KLK8O60259 260 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 FGF19O95750 216 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 CHEK2O96017 543 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 EPHX1P07099 455 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 OR56A5P0C7T3 313 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 UROSP10746 265 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 VIPR1P32241 457 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 VHLP40337 213 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 LRP8Q14114 963 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 ZNF234Q14588 700 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 TRIP10Q15642 601 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 C6orf136Q5SQH8 315 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 BRAT1Q6PJG6 821 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 IZUMO2Q6UXV1 221 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 PGAM4Q8N0Y7 254 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 KLK6Q92876 244 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 SMARCD2Q92925 531 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 ULK4Q96C45 1275 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 HPS4Q9NQG7 708 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 MAP10Q9P2G4 905 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 V9GYQ6 96 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 COL6A3P12111 3177 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 ANGPT2O15123 496 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 MLYCDO95822 493 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 G6PDP11413 515 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 SLC2A4P14672 509 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 PAX7P23759 505 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME3-201ENST00000293362 HOXA9P31269 272 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms