RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc7a8Q9QXW9 531 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcne5Q9QZ26 143 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tp53bp1P70399 1969 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SmoktcrA2KF29 484 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem233D3Z1U7 110 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r65G3X931 845 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RbpjlO08674 515 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tuba1cP68373 449 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Alg6Q3TAE8 507 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krt2Q3TTY5 707 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc13a5Q67BT3 572 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ube2q1Q7TSS2 422 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 B3galnt2Q8BG28 504 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arhgap28Q8BN58 729 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ifi44Q8BV66 422 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Frs2Q8C180 508 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rcor1Q8CFE3 480 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1310Q8VF85 312 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rmnd5bQ91YQ7 393 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MvdQ99JF5 401 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cryl1Q99KP3 319 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpn2Q9DBG6 631 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tuba8Q9JJZ2 449 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rai2Q9QVY8 529 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r49Q9WUF1 310 aa17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam46dB1ATX6 390 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fzd1O70421 642 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hoxa4P06798 285 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 En1P09065 401 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cpa3P15089 417 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Myf6P15375 242 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyr61P18406 379 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spata6Q3U6K5 488 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A630001G21RikQ3UTB2 229 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem255bQ5FW56 369 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FaddQ61160 205 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr735Q7TRM4 354 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rbbp5Q8BX09 538 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Clic5Q8BXK9 251 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HnrnplQ8R081 586 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ak5Q920P5 562 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mlf2Q99KX1 247 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ribc2Q9D4Q1 309 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Snap29Q9ERB0 260 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pld1Q9Z280 1074 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Osbpl10S4R1M9 766 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kbtbd6E9PYD7 486 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Speer4cG3UXD1 256 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kbtbd7G5E8C2 690 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10354K7N6A0 256 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TertO70372 1122 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pdlim1O70400 327 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc22a2O70577 553 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 JunP05627 334 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SpnP15702 395 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc16a1P53986 493 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TekQ02858 1122 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cep295nlQ497N6 533 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rap1gap2Q5SVL6 712 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eif2b4Q61749 524 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Creb3Q61817 404 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nr6a1Q64249 495 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 N4bp1Q6A037 893 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Galnt7Q80VA0 657 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf639Q99KZ6 485 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ly6kQ9CWP4 154 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dusp26Q9D700 211 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cntd1Q9D995 334 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hapln2Q9ESM3 341 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pin1Q9QUR7 165 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rrn3B2RS91 656 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm8011K7N6Y5 207 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ctla2bP12400 113 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gdf3Q07104 366 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pnpla1Q3V1D5 599 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr325Q5NCD2 326 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Paqr9Q6TCG2 375 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Syt14Q7TN84 555 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smndc1Q8BGT7 238 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r198Q8R263 300 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1208Q8VG47 308 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MlycdQ99J39 492 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Clp1Q99LI9 425 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmbim6Q9D2C7 237 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Htr3bQ9JHJ5 437 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spag4Q9JJF2 443 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 VapaQ9WV55 249 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Col4a6B1AVK5 1691 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv10-94A0A075B5L1 115 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc28a1E9PXX9 648 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1600015I10RikE9Q745 711 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rnf169E9Q7F2 694 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10477F6SW83 55 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tnfaip1O70479 316 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp1a1P00184 524 aa17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.3 ms