Protein–RNA interactions for Protein: P09065

En1, Homeobox protein engrailed-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
En1P09065 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
En1P09065 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
En1P09065 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
En1P09065 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
En1P09065 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
En1P09065 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
En1P09065 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
En1P09065 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
En1P09065 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
En1P09065 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
En1P09065 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
En1P09065 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
En1P09065 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
En1P09065 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
En1P09065 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
En1P09065 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
En1P09065 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
En1P09065 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
En1P09065 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
En1P09065 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
En1P09065 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
En1P09065 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
En1P09065 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
En1P09065 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
En1P09065 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
En1P09065 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
En1P09065 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
En1P09065 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
En1P09065 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
En1P09065 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
En1P09065 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
En1P09065 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
En1P09065 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
En1P09065 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
En1P09065 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
En1P09065 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
En1P09065 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
En1P09065 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
En1P09065 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
En1P09065 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
En1P09065 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
En1P09065 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
En1P09065 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
En1P09065 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
En1P09065 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
En1P09065 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
En1P09065 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
En1P09065 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
En1P09065 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
En1P09065 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
En1P09065 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
En1P09065 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
En1P09065 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
En1P09065 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
En1P09065 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
En1P09065 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
En1P09065 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
En1P09065 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
En1P09065 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
En1P09065 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
En1P09065 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
En1P09065 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
En1P09065 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
En1P09065 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
En1P09065 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
En1P09065 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
En1P09065 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
En1P09065 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
En1P09065 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
En1P09065 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
En1P09065 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
En1P09065 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
En1P09065 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
En1P09065 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
En1P09065 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
En1P09065 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
En1P09065 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
En1P09065 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
En1P09065 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
En1P09065 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
En1P09065 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
En1P09065 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
En1P09065 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
En1P09065 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
En1P09065 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
En1P09065 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
En1P09065 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
En1P09065 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
En1P09065 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
En1P09065 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
En1P09065 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
En1P09065 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
En1P09065 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
En1P09065 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
En1P09065 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
En1P09065 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
En1P09065 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
En1P09065 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
En1P09065 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
En1P09065 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms