Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,56■■■□□ 2,8
Ribc2Q9D4Q1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Ribc2Q9D4Q1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Ribc2Q9D4Q1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Ribc2Q9D4Q1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Ribc2Q9D4Q1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Ribc2Q9D4Q1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ribc2Q9D4Q1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ribc2Q9D4Q1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ribc2Q9D4Q1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ribc2Q9D4Q1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ribc2Q9D4Q1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Ribc2Q9D4Q1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Ribc2Q9D4Q1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Ribc2Q9D4Q1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
Ribc2Q9D4Q1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Ribc2Q9D4Q1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Ribc2Q9D4Q1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ribc2Q9D4Q1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Ribc2Q9D4Q1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,45■■■□□ 2,14
Ribc2Q9D4Q1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ribc2Q9D4Q1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Ribc2Q9D4Q1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ribc2Q9D4Q1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ribc2Q9D4Q1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ribc2Q9D4Q1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
Ribc2Q9D4Q1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ribc2Q9D4Q1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ribc2Q9D4Q1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ribc2Q9D4Q1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Ribc2Q9D4Q1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Ribc2Q9D4Q1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ribc2Q9D4Q1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,53■■■□□ 2
Ribc2Q9D4Q1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ribc2Q9D4Q1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ribc2Q9D4Q1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Ribc2Q9D4Q1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ribc2Q9D4Q1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Ribc2Q9D4Q1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ribc2Q9D4Q1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Ribc2Q9D4Q1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Ribc2Q9D4Q1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Ribc2Q9D4Q1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Ribc2Q9D4Q1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ribc2Q9D4Q1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ribc2Q9D4Q1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ribc2Q9D4Q1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ribc2Q9D4Q1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Ribc2Q9D4Q1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ribc2Q9D4Q1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Ribc2Q9D4Q1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Ribc2Q9D4Q1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Ribc2Q9D4Q1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ribc2Q9D4Q1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Ribc2Q9D4Q1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Ribc2Q9D4Q1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ribc2Q9D4Q1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ribc2Q9D4Q1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ribc2Q9D4Q1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ribc2Q9D4Q1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ribc2Q9D4Q1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Ribc2Q9D4Q1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,67■■□□□ 1,86
Ribc2Q9D4Q1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ribc2Q9D4Q1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Ribc2Q9D4Q1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ribc2Q9D4Q1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ribc2Q9D4Q1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ribc2Q9D4Q1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ribc2Q9D4Q1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ribc2Q9D4Q1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Ribc2Q9D4Q1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ribc2Q9D4Q1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ribc2Q9D4Q1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ribc2Q9D4Q1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ribc2Q9D4Q1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Ribc2Q9D4Q1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ribc2Q9D4Q1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Ribc2Q9D4Q1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ribc2Q9D4Q1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Ribc2Q9D4Q1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ribc2Q9D4Q1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Ribc2Q9D4Q1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Ribc2Q9D4Q1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ribc2Q9D4Q1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ribc2Q9D4Q1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ribc2Q9D4Q1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ribc2Q9D4Q1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Ribc2Q9D4Q1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Ribc2Q9D4Q1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ribc2Q9D4Q1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Ribc2Q9D4Q1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Ribc2Q9D4Q1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Ribc2Q9D4Q1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ribc2Q9D4Q1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Ribc2Q9D4Q1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Ribc2Q9D4Q1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
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