Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ribc2Q9D4Q1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ribc2Q9D4Q1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ribc2Q9D4Q1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ribc2Q9D4Q1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Ribc2Q9D4Q1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ribc2Q9D4Q1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ribc2Q9D4Q1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ribc2Q9D4Q1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ribc2Q9D4Q1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ribc2Q9D4Q1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ribc2Q9D4Q1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ribc2Q9D4Q1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ribc2Q9D4Q1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ribc2Q9D4Q1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ribc2Q9D4Q1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ribc2Q9D4Q1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ribc2Q9D4Q1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ribc2Q9D4Q1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ribc2Q9D4Q1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ribc2Q9D4Q1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ribc2Q9D4Q1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ribc2Q9D4Q1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ribc2Q9D4Q1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ribc2Q9D4Q1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ribc2Q9D4Q1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ribc2Q9D4Q1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ribc2Q9D4Q1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ribc2Q9D4Q1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ribc2Q9D4Q1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ribc2Q9D4Q1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ribc2Q9D4Q1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ribc2Q9D4Q1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ribc2Q9D4Q1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ribc2Q9D4Q1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ribc2Q9D4Q1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ribc2Q9D4Q1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ribc2Q9D4Q1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ribc2Q9D4Q1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ribc2Q9D4Q1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ribc2Q9D4Q1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ribc2Q9D4Q1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ribc2Q9D4Q1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ribc2Q9D4Q1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ribc2Q9D4Q1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ribc2Q9D4Q1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ribc2Q9D4Q1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ribc2Q9D4Q1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ribc2Q9D4Q1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ribc2Q9D4Q1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ribc2Q9D4Q1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ribc2Q9D4Q1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ribc2Q9D4Q1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ribc2Q9D4Q1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ribc2Q9D4Q1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ribc2Q9D4Q1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ribc2Q9D4Q1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ribc2Q9D4Q1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ribc2Q9D4Q1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ribc2Q9D4Q1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ribc2Q9D4Q1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ribc2Q9D4Q1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ribc2Q9D4Q1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ribc2Q9D4Q1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ribc2Q9D4Q1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ribc2Q9D4Q1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ribc2Q9D4Q1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ribc2Q9D4Q1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ribc2Q9D4Q1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ribc2Q9D4Q1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ribc2Q9D4Q1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ribc2Q9D4Q1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ribc2Q9D4Q1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ribc2Q9D4Q1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ribc2Q9D4Q1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ribc2Q9D4Q1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ribc2Q9D4Q1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ribc2Q9D4Q1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ribc2Q9D4Q1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ribc2Q9D4Q1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ribc2Q9D4Q1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ribc2Q9D4Q1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ribc2Q9D4Q1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ribc2Q9D4Q1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ribc2Q9D4Q1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ribc2Q9D4Q1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ribc2Q9D4Q1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ribc2Q9D4Q1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ribc2Q9D4Q1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ribc2Q9D4Q1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ribc2Q9D4Q1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ribc2Q9D4Q1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ribc2Q9D4Q1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ribc2Q9D4Q1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ribc2Q9D4Q1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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