Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Krt2Q3TTY5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Krt2Q3TTY5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Krt2Q3TTY5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Krt2Q3TTY5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Krt2Q3TTY5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Krt2Q3TTY5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Krt2Q3TTY5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Krt2Q3TTY5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Krt2Q3TTY5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Krt2Q3TTY5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Krt2Q3TTY5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Krt2Q3TTY5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Krt2Q3TTY5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Krt2Q3TTY5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Krt2Q3TTY5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Krt2Q3TTY5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Krt2Q3TTY5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Krt2Q3TTY5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Krt2Q3TTY5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Krt2Q3TTY5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Krt2Q3TTY5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Krt2Q3TTY5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Krt2Q3TTY5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Krt2Q3TTY5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Krt2Q3TTY5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Krt2Q3TTY5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Krt2Q3TTY5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Krt2Q3TTY5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Krt2Q3TTY5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Krt2Q3TTY5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Krt2Q3TTY5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Krt2Q3TTY5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Krt2Q3TTY5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Krt2Q3TTY5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Krt2Q3TTY5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Krt2Q3TTY5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Krt2Q3TTY5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Krt2Q3TTY5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Krt2Q3TTY5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Krt2Q3TTY5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Krt2Q3TTY5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Krt2Q3TTY5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Krt2Q3TTY5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Krt2Q3TTY5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Krt2Q3TTY5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Krt2Q3TTY5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt2Q3TTY5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Krt2Q3TTY5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt2Q3TTY5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt2Q3TTY5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt2Q3TTY5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Krt2Q3TTY5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Krt2Q3TTY5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Krt2Q3TTY5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Krt2Q3TTY5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Krt2Q3TTY5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Krt2Q3TTY5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Krt2Q3TTY5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Krt2Q3TTY5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Krt2Q3TTY5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Krt2Q3TTY5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Krt2Q3TTY5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt2Q3TTY5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt2Q3TTY5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt2Q3TTY5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Krt2Q3TTY5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt2Q3TTY5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Krt2Q3TTY5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt2Q3TTY5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt2Q3TTY5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt2Q3TTY5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt2Q3TTY5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt2Q3TTY5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt2Q3TTY5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt2Q3TTY5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt2Q3TTY5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt2Q3TTY5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt2Q3TTY5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt2Q3TTY5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt2Q3TTY5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt2Q3TTY5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt2Q3TTY5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt2Q3TTY5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt2Q3TTY5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt2Q3TTY5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krt2Q3TTY5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krt2Q3TTY5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krt2Q3TTY5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt2Q3TTY5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt2Q3TTY5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt2Q3TTY5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt2Q3TTY5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krt2Q3TTY5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt2Q3TTY5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt2Q3TTY5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt2Q3TTY5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Krt2Q3TTY5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Krt2Q3TTY5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt2Q3TTY5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms