RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF839	A8K0R7	811 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495		H0Y8X5	98 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	NUAK1	O60285	661 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	BMP10	O95393	424 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	APBB3	O95704	486 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TPH1	P17752	444 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PFKL	P17858	780 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CD9	P21926	228 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ITPKA	P23677	461 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TTK	P33981	857 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CDKN2B	P42772	138 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CHRNA4	P43681	627 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CLDN2	P57739	230 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBTB16	Q05516	673 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SPEM2	Q0P670	501 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SERINC3	Q13530	473 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CST6	Q15828	149 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SMU1	Q2TAY7	513 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	BEND5	Q7L4P6	421 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ISOC1	Q96CN7	298 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC77	Q9BR77	488 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	DIABLO	Q9NR28	239 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	EBF1	Q9UH73	591 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		7.15	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495		B2RBV5	119 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	HR	O43593	1189 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SDC3	O75056	442 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CRTAM	O95727	393 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	RAD51	Q06609	339 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TFDP2	Q14188	446 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GNA13	Q14344	377 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MAPRE2	Q15555	327 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	APPL1	Q9UKG1	709 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	NENF	Q9UMX5	172 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	AP4S1	Q9Y587	144 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	KNTC1	P50748	2209 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	MMP20	O60882	483 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	JRK	O75564	520 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	TGDS	O95455	350 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	IGSF6	O95976	241 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CTSL	P07711	333 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SP9	P0CG40	484 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PHC1	P78364	1004 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	BCL2L1	Q07817	233 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	CALCOCO2	Q13137	446 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PDK2	Q15119	407 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBED5	Q49AG3	693 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	DOK6	Q6PKX4	331 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LETMD1-238	ENST00000623495	PDPR	Q8NCN5	879 aa		7.14	□□□□□ -1.27

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