RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593223.1

SMAD4-216, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD4, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-216ENST00000593223 PCGF1Q9BSM1 259 aa4.85□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 STRA6Q9BX79 667 aa4.85□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa4.85□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 GHITMQ9H3K2 345 aa4.85□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 SCPEP1Q9HB40 452 aa4.85□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 KRT84Q9NSB2 600 aa4.85□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 EHD2Q9NZN4 543 aa4.85□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 TINAGQ9UJW2 476 aa4.85□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 VDAC3Q9Y277 283 aa4.85□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 PASKQ96RG2 1323 aa4.85□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 KIF1AQ12756 1690 aa4.85□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 UNC80Q8N2C7 3258 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 PKD1L3Q7Z443 1732 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 LRRC37A3O60309 1634 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 A0A1W2PRG0 241 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 PI4KAP2A4QPH2 592 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 GLTPD2A6NH11 291 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 BBOX1O75936 387 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 GOSR1O95249 250 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 TGDSO95455 350 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 PPP1R3DO95685 299 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 PMS2P2O95744 297 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 GUCA1CO95843 209 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 IL11P20809 199 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 ARL3P36405 182 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 COASYQ13057 564 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 MED22Q15528 200 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 TAF3Q5VWG9 929 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 C11orf88Q6PI97 169 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 CYP20A1Q6UW02 462 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 DLK2Q6UY11 383 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 NUP93Q8N1F7 819 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 ZNF619Q8N2I2 560 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 OR14L1PQ8NHC6 308 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 FAM122AQ96E09 287 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 GSDMAQ96QA5 445 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 DESI2Q9BSY9 194 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 KCNN2Q9H2S1 579 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 HAUS2Q9NVX0 235 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 TBC1D29Q9UFV1 150 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 SIX4Q9UIU6 781 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 PIAS3Q9Y6X2 628 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 MAU2Q9Y6X3 613 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD4-216ENST00000593223 NRXN1Q9ULB1 1477 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 MAGEA13PA6NCF6 341 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 C2orf81A6NN90 581 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 DOK2O60496 412 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 RFPL2O75678 378 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 SLC25A12O75746 678 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 APBB3O95704 486 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 MLYCDO95822 493 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 FTCDO95954 541 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 EGFP01133 1207 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 NEFHP12036 1026 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 ALDH3A2P51648 485 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 CLCNKAP51800 687 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 GAS1P54826 345 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 FOXM1Q08050 763 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 AP1B1Q10567 949 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 KRT24Q2M2I5 525 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 KDELC1Q6UW63 502 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 SMRP1Q8NCR6 262 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 FBXO30Q8TB52 745 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 MAGEC3Q8TD91 643 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 ORAI1Q96D31 301 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 PERPQ96FX8 193 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 TMEM19Q96HH6 336 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 LMLNQ96KR4 655 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 FSD1Q9BTV5 496 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 GAREM1Q9H706 876 aa4.83□□□□□ -1.64
SMAD4-216ENST00000593223 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms