RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 S100GP29377 79 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD52P31358 61 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AP3S2P59780 193 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RTL4Q6ZR62 310 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPTC7Q8NI37 304 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF563Q8TA94 476 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAJB4Q9UDY4 337 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF432O94892 652 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PARGQ86W56 976 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRC20Q8TCA0 184 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATG10Q9H0Y0 220 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAGEB17A8MXT2 336 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC7A1P30825 629 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM74Q86UV6 250 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM73Q86UV7 250 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CRYBG2Q8N1P7 616 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MINDY2Q8NBR6 621 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNX33Q8WV41 574 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDADC1Q9BWV3 514 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MALT1Q9UDY8 824 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLDN11O75508 207 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPIAP49247 311 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NECTIN3Q9NQS3 549 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OGNP20774 298 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EBF2Q9HAK2 575 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPAM1P38567 509 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTPN9P43378 593 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TIFAQ96CG3 184 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SIPA1Q96FS4 1042 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF558Q96NG5 402 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC115Q96NT0 180 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRT33AO76009 404 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COLEC12Q5KU26 742 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FCGR1BQ92637 280 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC38A4Q969I6 547 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAS2R7Q9NYW3 318 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GMIPQ9P107 970 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RIIAD1A6NNX1 92 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ITM2AO43736 263 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RORCP51449 518 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAE1Q13564 534 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 USP41Q3LFD5 358 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MATN3O15232 486 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATG13O75143 517 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSKH1P11801 424 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACADLP28330 430 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGFLR1Q9H665 355 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MID1O15344 667 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RHOQP17081 205 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UGT1A6P19224 532 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UGT1A1P22309 533 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UGT1A4P22310 534 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UGT1A3P35503 534 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHC1P78364 1004 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSC22D1Q15714 1073 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IQCF2Q8IXL9 164 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TFAP2BQ92481 460 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RFKQ969G6 155 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF31Q96EP0 1072 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C22orf31O95567 290 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UGT2B4P06133 528 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALDH3A2P51648 485 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FRRS1Q6ZNA5 592 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEK7Q8TDX7 302 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POF1BQ8WVV4 589 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KAT2AQ92830 837 aa16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms