RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 TIGD2Q4W5G0 525 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 TSPEARQ8WU66 669 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 C10orf82Q8WW14 230 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 TCF25Q9BQ70 676 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 WASF3Q9UPY6 502 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 A0A0G2JMP0 313 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 HSPA12AO43301 675 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 PRAF2O60831 178 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 AOC1P19801 751 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 RPA4Q13156 261 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 SGCGQ13326 291 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 MGAT5BQ3V5L5 792 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 IFI44LQ53G44 452 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 ZBTB2Q8N680 514 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 SLC37A3Q8NCC5 494 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 OR4M2Q8NGB6 313 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 C19orf12Q9NSK7 152 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 KCNN3Q9UGI6 736 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 PREX1Q8TCU6 1659 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 NID2Q14112 1375 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 C5orf51A6NDU8 294 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 CYP27B1O15528 508 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 INMTO95050 263 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 RASAL1O95294 804 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 LINC00032P0C843 101 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 TUBP50607 506 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 XKR4Q5GH76 650 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 PNCKQ6P2M8 343 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 SLC13A3Q8WWT9 602 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 OR5B12Q96R08 314 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 TXN2Q99757 166 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 MROH8Q9H579 483 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 SPG21Q9NZD8 308 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 ABCD2Q9UBJ2 740 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 PTPRMP28827 1452 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 H3BUI4 141 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 RASGRP1O95267 797 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 CACNB3P54284 484 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 SPIN4Q56A73 249 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 NCEH1Q6PIU2 408 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 BRINP3Q76B58 766 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRB-202ENST00000334414 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 FNIP2Q9P278 1114 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRB-202ENST00000334414 NDUFB10O96000 172 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 TPH1P17752 444 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 TNNI3P19429 210 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 PSMB4P28070 264 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 ACTA2P62736 377 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 ACTG2P63267 376 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 NTRK3Q16288 839 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 UNC5AQ6ZN44 842 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 FAM131BQ86XD5 332 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 NEK7Q8TDX7 302 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRB-202ENST00000334414 FAIMQ9NVQ4 179 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRB-202ENST00000334414 DIP2BQ9P265 1576 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 DNM1LO00429 736 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRB-202ENST00000334414 RPP40O75818 363 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 ATG12O94817 140 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 C8GP07360 202 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 CERS1P27544 350 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 CD6P30203 668 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 SMSP52788 366 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 THOP1P52888 689 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-202ENST00000334414 HERVK_113P63132 956 aa5.45□□□□□ -1.54
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