RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 KCNAB2Q13303 367 aa14.71□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 TUSC3Q13454 348 aa14.71□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 KIAA0040Q15053 153 aa14.71□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.71□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.71□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 MIB1Q86YT6 1006 aa14.71□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 OR2T12Q8NG77 320 aa14.71□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 METTL6Q8TCB7 284 aa14.71□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 CCDC138Q96M89 665 aa14.71□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 SMIM14Q96QK8 99 aa14.71□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 USE1Q9NZ43 259 aa14.71□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 BAG5Q9UL15 447 aa14.71□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SYP-201ENST00000263233 PLXNA3P51805 1871 aa14.71□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 VPS26AO75436 327 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 GMNNO75496 209 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ALDH2P05091 517 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 EPS8Q12929 822 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PARP8Q8N3A8 854 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 AADATQ8N5Z0 425 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CD200R1Q8TD46 325 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CPQQ9Y646 472 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CLDN25C9JDP6 229 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 INMTO95050 263 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TYMPP19971 482 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PCMT1P22061 227 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 FUT4P22083 530 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 IL2P60568 153 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 OXA1LQ15070 435 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 NR6A1Q15406 480 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CTF1Q16619 201 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CCL14Q16627 93 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TRIM16LQ309B1 348 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 OR10A6Q8NH74 314 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ITPKCQ96DU7 683 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.7□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 SLC1A7O00341 560 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 GSTA4O15217 222 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ZNF623O75123 536 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 UGT2B11O75310 529 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ITIH1P19827 911 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 JAK1P23458 1154 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 GRK4P32298 578 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 HALP42357 657 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 RAD23AP54725 363 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ISL1P61371 349 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ZNF846Q147U1 533 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TAMM41Q96BW9 452 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 RMDN1Q96DB5 314 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ACTR8Q9H981 624 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 A0A0D9SEW6 157 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 KRBA1A5PL33 1030 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 GPR182O15218 404 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 UGT2B4P06133 528 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 RGRP47804 291 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CD300CQ08708 224 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TRIM32Q13049 653 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 IRF5Q13568 498 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MORN1Q5T089 497 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms