RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	TUB	P50607	506 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	MVD	P53602	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	AP3M2	P53677	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	DEFB103A	P81534	67 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	RBP5	P82980	135 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	MYL7	Q01449	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	RHAG	Q02094	409 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ID2	Q02363	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT3	Q14435	633 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NAB2	Q15742	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	MIDN	Q504T8	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CASD1	Q96PB1	797 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934		Q9N2J8	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SI	P14410	1827 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CENPF	P49454	3210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934		E5RJQ4	531 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934		F8W810	466 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TNNC2	P02585	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	GYPC	P04921	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	FCGR2A	P12318	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TNNT1	P13805	278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	UCHL3	P15374	230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CYP3A5	P20815	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PAX3	P23760	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	KLRC2	P26717	231 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	KRT9	P35527	623 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CLCNKB	P51801	687 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CDH8	P55286	799 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CETN1	Q12798	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TRPC3	Q13507	836 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TDG	Q13569	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	UPP1	Q16831	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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