RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 ERVPABLB-1P60509 514 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 ESRRGP62508 458 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 TWF1Q12792 350 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 MERTKQ12866 999 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 GTF2H2Q13888 395 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 CYP51A1Q16850 503 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 MYLK3Q32MK0 819 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 TTLL9Q3SXZ7 439 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 NANOGP8Q6NSW7 305 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 MACC1Q6ZN28 852 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 Q6ZSR9 355 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 METTL25Q8N6Q8 603 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 OR52E4Q8NGH9 312 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 ZFP28Q8NHY6 868 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 IGSF21Q96ID5 467 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 ZBTB18Q99592 522 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 SLC30A3Q99726 388 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 ZBED2Q9BTP6 218 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 HTATIP2Q9BUP3 242 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 VN1R3Q9BXE9 311 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 GRIP2Q9C0E4 1043 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 NANOGQ9H9S0 305 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 IL1RL2Q9HB29 575 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 WBP1LQ9NX94 342 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 ZNF639Q9UID6 485 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 ACTL7AQ9Y615 435 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 PTPRSQ13332 1948 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 KIAA1671Q9BY89 1806 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 H0YAE9 185 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 FFAR2O15552 330 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 RGS14O43566 566 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 OR1I1O60431 355 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 TBL1XO60907 577 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 GMNNO75496 209 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 LDLRP01130 860 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 SOD2P04179 222 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 ATP6V1B1P15313 513 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 UFM1P61960 85 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 SLC36A3Q495N2 470 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 GRAMD4Q6IC98 578 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 SBSNQ6UWP8 590 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 ITIH5Q86UX2 942 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 CBR4Q8N4T8 237 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 TERB1Q8NA31 727 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 PIH1D2Q8WWB5 315 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 HIC2Q96JB3 615 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 RDH12Q96NR8 316 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 CCDC115Q96NT0 180 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 CLSTN3Q9BQT9 956 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 ADI1Q9BV57 179 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 GKN1Q9NS71 199 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 YIPF1Q9Y548 306 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 ASPDHA6ND91 283 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 SOCS2O14508 198 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 INPP4BO15327 924 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 OLFM2O95897 454 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 CDH1P12830 882 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 RPL17P18621 184 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 HMOX2P30519 316 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 CDK9P50750 372 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 SGSHP51688 502 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 PLD1Q13393 1074 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 PWP1Q13610 501 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 RAB33AQ14088 237 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 PITRM1Q5JRX3 1037 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 MILR1Q7Z6M3 343 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 CDYL2Q8N8U2 506 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 SNX31Q8N9S9 440 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 OR2T11Q8NH01 316 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 ALG14Q96F25 216 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 LRCH3Q96II8 777 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 LYSMD1Q96S90 227 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 NTMT1Q9BV86 223 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 SLC29A3Q9BZD2 475 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 OSBPL6Q9BZF3 934 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 RNF38Q9H0F5 515 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 GIMAP2Q9UG22 337 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 TRPS1Q9UHF7 1281 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 VPS51Q9UID3 782 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 A0A1B0GTL3 188 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
PRAME-203ENST00000402697 CLGNO14967 610 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms