RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628883.2

PCBP1-AS1-335, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 891 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 GPR39O43194 453 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PMPCBO75439 489 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SPAG6O75602 509 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RASSF9O75901 435 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TIAF1O95411 115 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NELFEP18615 380 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 IDSP22304 550 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CA5AP35218 305 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CDKN2BP42772 138 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DYNLT1P63172 113 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 WASHC5Q12768 1159 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 IGFBP7Q16270 282 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CACHD1Q5VU97 1274 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MFSD7Q6UXD7 560 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 FAM92BQ6ZTR7 304 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RFX6Q8HWS3 928 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RHOT2Q8IXI1 618 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 OR8K1Q8NGG5 319 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DTX3LQ8TDB6 740 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CXorf40BQ96DE9 158 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SLC41A2Q96JW4 573 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TRABDQ9H4I3 376 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 BPIFA1Q9NP55 256 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 IL26Q9NPH9 171 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 UBP1Q9NZI7 540 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ANKMY1Q9P2S6 941 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 K7EM74 188 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RECKO95980 971 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 VCLP18206 1134 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NFKB1P19838 968 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NR1D1P20393 614 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CHRNA4P43681 627 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NR2C2P49116 596 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CTSCP53634 463 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PMS2P54278 862 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 WNT3AP56704 352 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SEPT6Q14141 434 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TRIM14Q14142 442 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TCEAL1Q15170 157 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SIRPB2Q5JXA9 342 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TCTN3Q6NUS6 607 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 IRGCQ6NXR0 463 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TMEM135Q86UB9 458 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PPP1R3BQ86XI6 285 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RASGRP3Q8IV61 690 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DDHD1Q8NEL9 900 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ANKK1Q8NFD2 765 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 BRSK1Q8TDC3 778 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ZDHHC12Q96GR4 267 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ELMO2Q96JJ3 720 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MRGPRX2Q96LB1 330 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CHP1Q99653 195 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DEF6Q9H4E7 631 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ABHD10Q9NUJ1 306 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SPTLC3Q9NUV7 552 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 IL17CQ9P0M4 197 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TRIM10Q9UDY6 481 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 FAM153AQ9UHL3 310 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 POLHQ9Y253 713 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 HYOU1Q9Y4L1 999 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MED13Q9UHV7 2174 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 C21orf140B9A014 251 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MKRN2OSH3BPM6 223 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 AKR1B10O60218 316 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 UGT1A9O60656 530 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 KCNJ13O60928 360 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 EPOP01588 193 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 FOLR1P15328 257 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 UGT1A6P19224 532 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 UGT1A1P22309 533 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 UGT1A4P22310 534 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SPAM1P38567 509 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 HALP42357 657 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SLC1A1P43005 524 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CD97P48960 835 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ADCY2Q08462 1091 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 KLRB1Q12918 225 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TUBB3Q13509 450 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DNASE1L3Q13609 305 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 LAMB3Q13751 1172 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 GTF2H3Q13889 308 aa10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms