RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548206.1

CSRNP2-203, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene CSRNP2, Length 685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-203ENST00000548206 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 CNSTQ6PJW8 725 aa22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 LRRC6Q86X45 466 aa22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 CLDN19Q8N6F1 224 aa22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 SGF29Q96ES7 293 aa22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 CPNE1Q99829 537 aa22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 GPSM3Q9Y4H4 160 aa22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 PSAT1Q9Y617 370 aa22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 PRSS21Q9Y6M0 314 aa22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 KNL1Q8NG31 2342 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 A0A1B0GTQ1 180 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 QSOX1O00391 747 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 GRID2O43424 1007 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 DNAJC6O75061 913 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 OR56A5P0C7T3 313 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 GP5P40197 560 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 ABCG1P45844 678 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 BLKP51451 505 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 GALNT7Q86SF2 657 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 LRRTM4Q86VH4 590 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 PHACTR4Q8IZ21 702 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 MREGQ8N565 214 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 OR2M4Q96R27 311 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.15■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa22.14■■□□□ 1.14
CSRNP2-203ENST00000548206 H3BM21 787 aa22.14■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 AHSGP02765 367 aa22.14■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 INHBAP08476 426 aa22.14■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.14■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 KCTD16Q68DU8 428 aa22.14■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 OXR1Q8N573 874 aa22.14■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.14■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.14■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 P2RY12Q9H244 342 aa22.14■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 H3BMM5 538 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 CHUKO15111 745 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 KMOO15229 486 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 FLRT2O43155 660 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 FTH1P02794 183 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 ESR1P03372 595 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 ADRB1P08588 477 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 CTSEP14091 401 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 PKMP14618 531 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 JUNDP17535 347 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 GABRB3P28472 473 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 MSH2P43246 934 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 HK3P52790 923 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 BCL7AQ4VC05 210 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 PYCR3Q53H96 274 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 GRTP1Q5TC63 336 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 GPATCH11Q8N954 259 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 PAFAH2Q99487 392 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 GPR34Q9UPC5 381 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 DGKBQ9Y6T7 804 aa22.13■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 TPRP12270 2363 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 PCDHGA12O60330 932 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 FAM155BO75949 473 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 TRIM16O95361 564 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 FUCA1P04066 466 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 ITGB6P18564 788 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 PRLHRP49683 370 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 ADARP55265 1226 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 SHBQ15464 509 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 TCEA2Q15560 299 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 INSCQ1MX18 579 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 CTSL3PQ5NE16 218 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 DBX2Q6ZNG2 339 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 GATAD2AQ86YP4 633 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 NDNQ99608 321 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 RHOJQ9H4E5 214 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa22.12■■□□□ 1.13
CSRNP2-203ENST00000548206 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms