RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469271.1

NOM1-203, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 1,209 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-203ENST00000469271 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 GATA6Q92908 595 aa20.14■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 SLC38A3Q99624 504 aa20.14■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.14■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.14■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 RP1P56715 2156 aa20.14■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 OR51F1A6NGY5 319 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 D6RAR5 112 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 PPM1DO15297 605 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 AVILO75366 819 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CSO75390 466 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 ALDH4A1P30038 563 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 MAGEA3P43357 314 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TTPAP49638 278 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CLDN6P56747 220 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CCL7P80098 99 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 GPLD1P80108 840 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 METRNLQ641Q3 311 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 HM13Q8TCT9 377 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 DPYSL5Q9BPU6 564 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 UCK1Q9HA47 277 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 POT1Q9NUX5 634 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.13■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 A0A1W2PQM1 296 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TMEM8BA6NDV4 472 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 PFDN6O15212 129 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 SGTAO43765 313 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 VIPP01282 170 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 NMBRP28336 390 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 NFE2L1Q14494 772 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 MORF4L2Q15014 288 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 ISXQ2M1V0 245 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 NXPE2Q96DL1 559 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 MFSD3Q96ES6 412 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TMEM74Q96NL1 305 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 KRT12Q99456 494 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CCM2Q9BSQ5 444 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.12■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 ACACBO00763 2458 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CPNE6O95741 557 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 FTH1P02794 183 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 OR56A5P0C7T3 313 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 PRSS56P0CW18 603 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 IVDP26440 423 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 EPHA4P54764 986 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 OR1D5P58170 312 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CAMK2BQ13554 666 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 OR10G6Q8NH81 332 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CXorf40BQ96DE9 158 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.11■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TTI1O43156 1089 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 B4GAT1O43505 415 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 VAPBO95292 243 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 BRAFP15056 766 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 RPA4Q13156 261 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 SQSTM1Q13501 440 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 AMZ1Q400G9 498 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 MAP9Q49MG5 647 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 PIM3Q86V86 326 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CFAP206Q8IYR0 622 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 BBOF1Q8ND07 529 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 SNF8Q96H20 258 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 NAT9Q9BTE0 207 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 STRADBQ9C0K7 418 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms