RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	LPGAT1	Q92604	370 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	CACNA1E	Q15878	2313 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SGTA	O43765	313 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNX2	O60749	519 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	FTH1	P02794	183 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANXA6	P08133	673 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHRM3	P20309	590 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACTR1B	P42025	376 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCG1	P45844	678 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRLHR	P49683	370 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACTR1A	P61163	376 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRP8	Q14114	963 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	BRD3	Q15059	726 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	BCL7A	Q4VC05	210 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRC6	Q86X45	466 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC25A45	Q8N413	288 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAP25	Q8TEE9	199 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM136A	Q96C01	138 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYTH2	Q99418	400 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	P2RY12	Q9H244	342 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSAT1	Q9Y617	370 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402		E5RI56	91 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	YY2	O15391	372 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	RIPK2	O43353	540 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	ESR1	P03372	595 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	GABRB3	P28472	473 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD151	P48509	253 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25	5e-6	■■■■□ 20.9
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	NRROS	Q86YC3	692 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRT222	Q8N1A0	295 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	ELMO1	Q92556	727 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM122A	Q96E09	287 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	BIRC8	Q96P09	236 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	MGAT4D	A6NG13	374 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	LMO7DN	F2Z398	122 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF883	P0CG24	379 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGAP8	P85298	464 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	NFE2L1	Q14494	772 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC29A2	Q14542	456 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYTL3	Q4VX76	610 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	STPG1	Q5TH74	334 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	EMB	Q6PCB8	327 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	EID2	Q8N6I1	236 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPATCH11	Q8N954	259 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR2L2	Q8NH16	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	PANX3	Q96QZ0	392 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	NDN	Q99608	321 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPNE1	Q99829	537 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRP4	O75096	1905 aa		13.46	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402		B4DGG1	531 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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