RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM107BQ9H098 131 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 PREBQ9HCU5 417 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 OXSMQ9NWU1 459 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL42Q9P2K6 505 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 ATG16L1Q676U5 607 aa24.56■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB2Q8N680 514 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 PLA2G15Q8NCC3 412 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6Y1Q8NGX8 325 aa24.56■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 SGF29Q96ES7 293 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 LINGO1Q96FE5 620 aa24.56■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 DGKEP52429 567 aa24.55■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 FGL2Q14314 439 aa24.55■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa24.55■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 FLCNQ8NFG4 579 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 NELL2Q99435 816 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 PITPNM3Q9BZ71 974 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQU0 124 aa24.54■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM13O60858 407 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TPMTP51580 245 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 GAS6Q14393 721 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4D1Q15615 310 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa24.54■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 HORMAD1Q86X24 394 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 UBALD2Q8IYN6 164 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 SIX5Q8N196 739 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 OSBPL6Q9BZF3 934 aa24.54■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 IKZF3Q9UKT9 509 aa24.54■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D3EA0A087X179 549 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC189A1A4V9 331 aa24.53■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D3LB9A6J9 549 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D3HP0C7X1 549 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 DGKAP23743 735 aa24.53■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 PRKAA2P54646 552 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 STX3Q13277 289 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa24.53■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 COX14Q96I36 57 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ATOH8Q96SQ7 321 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TSSK1BQ9BXA7 367 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXQ1Q9C009 403 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 EPHX3Q9H6B9 360 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM39Q9HCM9 518 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ITM2CQ9NQX7 267 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR23AA6NEV1 266 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM170BA6NMN3 283 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 F8W8V4 182 aa24.52■■□□□ 1.52
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CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINE1P05121 402 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 GRK2P25098 689 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 AOAHP28039 575 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TEAD1P28347 426 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 RGS4P49798 205 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 CTSCP53634 463 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 SGCGQ13326 291 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TTLL9Q3SXZ7 439 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 LIPMQ5VYY2 423 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM67Q6ZTA4 783 aa24.52■■□□□ 1.52
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