RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC12Q96GR4 267 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 ELMO2Q96JJ3 720 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 FURINP09958 794 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 ERV3-1Q14264 604 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 TEX44Q53QW1 395 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 RAB33BQ9H082 229 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 BPIFA1Q9NP55 256 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM10Q9UDY6 481 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 KCND3Q9UK17 655 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 WDR37Q9Y2I8 494 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC18AA5D8T8 446 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 PMPCBO75439 489 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 SPAG6O75602 509 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 VCLP18206 1134 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 NELFEP18615 380 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP25P42331 645 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 KLRB1Q12918 225 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC18BQ6UXF7 455 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 FAM92BQ6ZTR7 304 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC18CQ8NCF0 446 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 TEKT5Q96M29 485 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA5BQ9P283 1151 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 POLHQ9Y253 713 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 KATNA1O75449 491 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 CCNYL3P0C7X3 344 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 HMGCLP35914 325 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 GTF2H3Q13889 308 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC38Q5VT99 294 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 TCTN3Q6NUS6 607 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 IRGCQ6NXR0 463 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R3BQ86XI6 285 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 RFX6Q8HWS3 928 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 GDAP1Q8TB36 358 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 BRSK1Q8TDC3 778 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 DEF6Q9H4E7 631 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 IL26Q9NPH9 171 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 UBP1Q9NZI7 540 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 PADI1Q9ULC6 663 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 MKRN2OSH3BPM6 223 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 K7EM74 188 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 KCNJ13O60928 360 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 RECKO95980 971 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 MT-ND3P03897 115 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 KRT1P04264 644 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 PTPN3P26045 913 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 HALP42357 657 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 DYNLT1P63172 113 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 DTX3LQ8TDB6 740 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJC7Q99615 494 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 TRABDQ9H4I3 376 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 PLAAQ9Y263 795 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 CREG1O75629 220 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 NR1D1P20393 614 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 FECHP22830 423 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1CAP62136 330 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 DMPKQ09013 629 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 DNASE1L3Q13609 305 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 CYB5D1Q6P9G0 228 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM135Q86UB9 458 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 AMZ2Q86W34 360 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 TTC30BQ8N4P2 665 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 SLC41A2Q96JW4 573 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 TTC25Q96NG3 672 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 LHX9Q9NQ69 397 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 FAM153AQ9UHL3 310 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 PIPSLA2A3N6 862 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 AKR1B10O60218 316 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 TIAF1O95411 115 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 CD68P34810 354 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 NR2C2P49116 596 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 WNT3AP56704 352 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 NOMO1Q15155 1222 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 KDELC1Q6UW63 502 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 GPR150Q8NGU9 434 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 CT55Q8WUE5 264 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 UBXN4Q92575 508 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 MIB2Q96AX9 1013 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 TWSG1Q9GZX9 223 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 PDE7BQ9NP56 450 aa24.42■■□□□ 1.5
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